More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2909 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  80.15 
 
 		 403 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2106  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  81.39 
 
 		 404 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.247023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2909  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 		 404 aa  837    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  80.4 
 
 		 403 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1760  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  66.08 
 
 		 401 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.832765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0681  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.82 
 
 		 401 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15800  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  63.77 
 
 		 407 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  63.52 
 
 		 408 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.66 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1438  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  62.81 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2066  phosphofructokinase  63 
 
 		 406 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1905  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  61.04 
 
 		 408 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0322067  hitchhiker  0.000281124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0150  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.64 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  58.9 
 
 		 418 aa  488  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  58.56 
 
 		 406 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55126  PFP pyrophosphate dependent phosphofructokinase  46.91 
 
 		 418 aa  354  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  30.61 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.12 
 
 		 439 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.69 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.46 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.41 
 
 		 461 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.91 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  26.26 
 
 		 343 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  25.98 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  28.47 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  30.36 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  25.62 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.36 
 
 		 444 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.38 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.81 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  22.83 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.46 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  26.37 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  27.84 
 
 		 460 aa  86.7  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  27.72 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  27.34 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.81 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  27.76 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.98 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  27.9 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  28.33 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  26.94 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  27.59 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  25 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  24.93 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  22.19 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  26.33 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  31.66 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  25.41 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  27.3 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.8 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  28.33 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  23.48 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.59 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.76 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  26.32 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  27.65 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  26.18 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  25.34 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  25.57 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  30.43 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  26.04 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  29.29 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.41 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  26.09 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  32.32 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  25.07 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.9 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  25.83 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  26.69 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  30.29 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  29.33 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  28.4 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  25 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  25.99 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  24.58 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  25.84 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  29.7 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  25.42 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  25.45 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  26.35 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.94 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  29.19 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  27.16 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  23.1 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  28.24 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  27.3 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  25.59 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.175104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>