More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3098 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
408 aa  837    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2066  phosphofructokinase  72.93 
 
 
406 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1905  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  71.68 
 
 
408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0322067  hitchhiker  0.000281124 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  68.63 
 
 
408 aa  569  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15800  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  70.6 
 
 
407 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1438  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  69.6 
 
 
399 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  67.84 
 
 
406 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0150  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  68.15 
 
 
413 aa  547  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0681  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  67.42 
 
 
401 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.73 
 
 
418 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1760  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  65.34 
 
 
401 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.832765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2106  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  62.66 
 
 
404 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.247023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2909  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.66 
 
 
404 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  61.94 
 
 
403 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  61.19 
 
 
403 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55126  PFP pyrophosphate dependent phosphofructokinase  53.35 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.33 
 
 
439 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.93 
 
 
445 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.77 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  29.9 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  26.14 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  27.58 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.24 
 
 
461 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  28.09 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  27.44 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  26.12 
 
 
460 aa  90.5  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  27.44 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  27.37 
 
 
342 aa  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  28.81 
 
 
342 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  26.59 
 
 
342 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  29.38 
 
 
341 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.67 
 
 
439 aa  86.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  24.56 
 
 
416 aa  87  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.47 
 
 
429 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.15 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.78 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.9 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  27.97 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  28 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29.94 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  25.76 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.39 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  27.6 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.87 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  27.47 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  26.11 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  28.83 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.51 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.22 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  27.47 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  27.57 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  26.33 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  25.77 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  26.7 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  26.03 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.14 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  29.78 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  32.16 
 
 
323 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  32 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  27.32 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  25.86 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  28.91 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.56 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.72 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  26.65 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  27.05 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  31.11 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.72 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  25.93 
 
 
327 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.72 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  25.35 
 
 
403 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  25.57 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  27.74 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  30.67 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  27.42 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  27.69 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.26 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  26.69 
 
 
363 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  24.45 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  25.82 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  25.82 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  25.82 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  26.65 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  29 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.43 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  27.03 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  29.33 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  25.61 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  24.62 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  28 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  25.42 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.18 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  23.57 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  32.69 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  27.61 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  28.07 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>