More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55126 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_55126  PFP pyrophosphate dependent phosphofructokinase  100 
 
 
418 aa  871    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.22 
 
 
408 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1905  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.5 
 
 
408 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0322067  hitchhiker  0.000281124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0150  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.97 
 
 
413 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1438  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.61 
 
 
399 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15800  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  52.11 
 
 
407 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  51.73 
 
 
408 aa  388  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.02 
 
 
406 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.37 
 
 
418 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2066  phosphofructokinase  50.37 
 
 
406 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0681  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  47.19 
 
 
401 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2106  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.27 
 
 
404 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.247023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2909  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  46.91 
 
 
404 aa  359  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  49.01 
 
 
403 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.51 
 
 
403 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1760  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.15 
 
 
401 aa  348  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.832765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  26.65 
 
 
343 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.03 
 
 
439 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.53 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.34 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  32.35 
 
 
447 aa  89.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  26.2 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.67 
 
 
445 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.94 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.12 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  25.54 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.85 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.17 
 
 
437 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47690  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  25 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  25.27 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  26.55 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.6 
 
 
444 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.86 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  27.72 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  23.84 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  24.86 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  22.74 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  24.8 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  25.21 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  24.94 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  22.87 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  22.93 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  25.41 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.12 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  26.12 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  25.54 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  26.02 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  24.52 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2276  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  28.07 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.719856  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  29.9 
 
 
322 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  25.13 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  24.93 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  25.58 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  28.43 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  27.71 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  26.52 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
324 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  26.6 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  22.03 
 
 
429 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  23.71 
 
 
341 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  26.22 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  27.32 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  24.38 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0033  6-phosphofructokinase  28.92 
 
 
327 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  25.66 
 
 
372 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  24.32 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  26.49 
 
 
343 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  24.29 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  25.21 
 
 
340 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  25.61 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  24.38 
 
 
319 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  23.85 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  24.93 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1331  phosphofructokinase  25.55 
 
 
680 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  26.33 
 
 
344 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  27.94 
 
 
366 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  27.09 
 
 
347 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  28.08 
 
 
326 aa  63.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  27.45 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50424  phosphofructokinase  26.29 
 
 
515 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  26.96 
 
 
326 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0623  6-phosphofructokinase  26.09 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  23.04 
 
 
365 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  22.41 
 
 
343 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.65 
 
 
349 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51286  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  25.51 
 
 
563 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  27.39 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0648  6-phosphofructokinase  26.09 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0426805  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0163  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.73 
 
 
549 aa  62.4  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  23.93 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  25.4 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.56 
 
 
429 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  26.98 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  26 
 
 
328 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1875  6-phosphofructokinase  26.94 
 
 
744 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.507324  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  26.98 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0020  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.98 
 
 
555 aa  61.6  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  23.16 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  26.98 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>