More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2106 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  82.38 
 
 		 403 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  82.38 
 
 		 403 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2106  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 		 404 aa  832    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.247023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2909  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  81.39 
 
 		 404 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1760  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  68.59 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.832765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0681  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  66.08 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15800  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  64.82 
 
 		 407 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2066  phosphofructokinase  63.32 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  62.66 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  62.03 
 
 		 418 aa  504  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1438  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  61.31 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1905  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  61.56 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0322067  hitchhiker  0.000281124 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  60.3 
 
 		 408 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0150  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  62.78 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  57.64 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55126  PFP pyrophosphate dependent phosphofructokinase  48.27 
 
 		 418 aa  354  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.15 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.02 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.64 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.18 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.19 
 
 		 439 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  27.25 
 
 		 342 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.58 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  28.24 
 
 		 343 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  28.89 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  24.37 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  24.85 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  26.84 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  27.2 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  27.36 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  26.44 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  27.61 
 
 		 365 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.71 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  26.97 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  27.02 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  29.25 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  26.73 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  27.27 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  26.52 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  25.64 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  28 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  27.63 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29.49 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  26.92 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  27.47 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.76 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  26.85 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  29.05 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  26.13 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  32.16 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  32.46 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  28.23 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  26.82 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  28.33 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  30.35 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  28 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  24.92 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.07 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  25.32 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  26.82 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  25.33 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  25.66 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  24.02 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  26.19 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  25.2 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  27.76 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  28.96 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.91 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  29 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  24.2 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  29.58 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  29 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  29 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  25.08 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  31.05 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  26.49 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  28.43 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01919  6-phosphofructokinase  31.34 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  25.16 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  27.93 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  27.43 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  25.22 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.18 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 343 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.05 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  26.35 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  27.11 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  30.41 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.93 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  29.72 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.78 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  25.47 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.07 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  30.22 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1623  6-phosphofructokinase  25.59 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  28.11 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  29.84 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>