More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3204 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  100 
 
 
419 aa  869    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  68.33 
 
 
421 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  69.08 
 
 
420 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  67.15 
 
 
414 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  67.15 
 
 
414 aa  606  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  66.35 
 
 
419 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  67.15 
 
 
420 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  68.75 
 
 
420 aa  597  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  65.48 
 
 
418 aa  578  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  64.58 
 
 
420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  66.02 
 
 
421 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  64.82 
 
 
420 aa  574  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  66.59 
 
 
419 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  60.58 
 
 
418 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  60.53 
 
 
418 aa  481  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  56.97 
 
 
419 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  59.38 
 
 
417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  59.13 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  52.88 
 
 
421 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  56.31 
 
 
418 aa  448  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  53.12 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  53.61 
 
 
422 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  48.15 
 
 
407 aa  402  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  49.5 
 
 
394 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  48.25 
 
 
424 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  50.71 
 
 
417 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  48.77 
 
 
422 aa  375  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  46.52 
 
 
418 aa  364  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  45.99 
 
 
415 aa  348  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  46.06 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  44.44 
 
 
415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  44.94 
 
 
414 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 
414 aa  325  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  43.2 
 
 
415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  40.25 
 
 
408 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  38.42 
 
 
404 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  40.35 
 
 
403 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  38.07 
 
 
447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  36.5 
 
 
400 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  36.5 
 
 
400 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  38.77 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  37.65 
 
 
404 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  37.26 
 
 
406 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  37.44 
 
 
404 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  38.31 
 
 
402 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  36.45 
 
 
404 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  33.92 
 
 
460 aa  231  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  38.67 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  36.25 
 
 
405 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  34.04 
 
 
378 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  33.17 
 
 
406 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  31.46 
 
 
388 aa  156  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  31.66 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  31.87 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.49 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  30.07 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  30.56 
 
 
340 aa  116  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.44 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  30.58 
 
 
341 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.75 
 
 
346 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  28.78 
 
 
360 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  29.39 
 
 
342 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.85 
 
 
461 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  30.32 
 
 
345 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  29.05 
 
 
342 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.11 
 
 
341 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  32.03 
 
 
349 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  27.71 
 
 
340 aa  107  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  31.64 
 
 
341 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  31.25 
 
 
368 aa  106  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  32.06 
 
 
344 aa  106  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
342 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 
343 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  28.47 
 
 
341 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  30.15 
 
 
341 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  30.15 
 
 
367 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  29.35 
 
 
341 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.39 
 
 
341 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  29.26 
 
 
342 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  31.44 
 
 
342 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  31.3 
 
 
368 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  26.75 
 
 
341 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.79 
 
 
341 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.63 
 
 
445 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  30.65 
 
 
343 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  29.45 
 
 
343 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  28.66 
 
 
343 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  28.66 
 
 
343 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  28.66 
 
 
343 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  26.37 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  30.51 
 
 
363 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  26.58 
 
 
343 aa  96.7  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  29.49 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  30.12 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  29.69 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  29.87 
 
 
359 aa  95.5  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  28.01 
 
 
440 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  25.28 
 
 
350 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  28.8 
 
 
363 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  29.5 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>