More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3345 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  100 
 
 		 408 aa  845    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  50.25 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  49.01 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  47.76 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  44.37 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  47.77 
 
 		 415 aa  362  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  45.31 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  44.78 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  43.84 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  44.09 
 
 		 409 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  42.64 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  42.64 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  42.47 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  40.77 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  41.69 
 
 		 420 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  40.25 
 
 		 419 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  41.18 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  42.72 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  42.72 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  41.87 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  40.63 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  41.22 
 
 		 418 aa  286  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  39.26 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  39.26 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  40.39 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  40.25 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  40.69 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  41.29 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  39.26 
 
 		 421 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  39.45 
 
 		 421 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  41.25 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  40.64 
 
 		 418 aa  260  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  40.79 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  40.29 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  37.5 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  39.85 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  38.48 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  39.8 
 
 		 418 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  39.02 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  37.5 
 
 		 424 aa  236  7e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  38.93 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  39.44 
 
 		 403 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  40.05 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  38.02 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  37.04 
 
 		 429 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  39.44 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  38.52 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  38.68 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  39.49 
 
 		 404 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  37.28 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  32.07 
 
 		 402 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  33.76 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  30.53 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.47 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  31.16 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  31.39 
 
 		 346 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.82 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  30.85 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  33.33 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  30.58 
 
 		 341 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  30.58 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  28.61 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  28.36 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  30.3 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  35.83 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  29.82 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  28.31 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  32.93 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  29.22 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  31.3 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  29.22 
 
 		 343 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  28.31 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  29.87 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  31.75 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  30.21 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  25.92 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  28.7 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  31.41 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  29.41 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  28.92 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  28.92 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  28.92 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  26.8 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  26.52 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  27.22 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  28.31 
 
 		 343 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 319 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  29.38 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  29.31 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  29.31 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  26.69 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>