More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2223 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  100 
 
 
415 aa  857    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  82.89 
 
 
415 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  61.35 
 
 
414 aa  550  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  54.74 
 
 
415 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  48.57 
 
 
418 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  49.01 
 
 
414 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  47.77 
 
 
408 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  49.02 
 
 
409 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  44.96 
 
 
407 aa  353  4e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  46.36 
 
 
420 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  44.34 
 
 
421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  45.5 
 
 
418 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  45.5 
 
 
421 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  44.9 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  43.54 
 
 
420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  43.61 
 
 
400 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  45.54 
 
 
414 aa  334  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  43.13 
 
 
420 aa  334  1e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  45.54 
 
 
414 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  43.13 
 
 
420 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  43.11 
 
 
400 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  43.69 
 
 
419 aa  332  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  43.93 
 
 
420 aa  328  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  44.85 
 
 
419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  45 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  42.72 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  41.87 
 
 
394 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  39.77 
 
 
447 aa  301  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  38.98 
 
 
404 aa  292  8e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  41.93 
 
 
418 aa  286  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  42.58 
 
 
419 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  42.47 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  42.68 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  42.47 
 
 
417 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  39.52 
 
 
429 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  41.94 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  39.04 
 
 
403 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  39.21 
 
 
404 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  40.49 
 
 
418 aa  262  6e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  41.16 
 
 
406 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
424 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
403 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  39.52 
 
 
402 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  42.05 
 
 
422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  40.25 
 
 
404 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  33.33 
 
 
460 aa  256  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  39.69 
 
 
404 aa  252  8.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  39.49 
 
 
405 aa  249  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  36.95 
 
 
406 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  36.97 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  30.55 
 
 
378 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  30.65 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 
388 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  33.49 
 
 
340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  32.42 
 
 
349 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.27 
 
 
346 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  28.81 
 
 
348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  28.23 
 
 
346 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  29.57 
 
 
341 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.55 
 
 
341 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  27.3 
 
 
341 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  31.3 
 
 
341 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  26.45 
 
 
340 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  31.28 
 
 
344 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  28.87 
 
 
342 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  28.08 
 
 
342 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.78 
 
 
341 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  28.52 
 
 
342 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  27.99 
 
 
367 aa  100  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  29.22 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  26.91 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.23 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  26.35 
 
 
336 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  26.47 
 
 
341 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  25.74 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  25.69 
 
 
360 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  27.46 
 
 
342 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  28.7 
 
 
356 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  28.96 
 
 
390 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  35.42 
 
 
341 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  28.96 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  25.42 
 
 
343 aa  93.2  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0642  6-phosphofructokinase  27.36 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  27.66 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  26.02 
 
 
340 aa  92  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  29.01 
 
 
341 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  24.45 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  25.91 
 
 
341 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  29.79 
 
 
320 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  27.3 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  27.36 
 
 
360 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  30.33 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  27.44 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  26.72 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  26.19 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  27.24 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  29.08 
 
 
320 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  25.07 
 
 
342 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  30.12 
 
 
366 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>