More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1446 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  99 
 
 
400 aa  812    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  100 
 
 
400 aa  818    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  47.62 
 
 
415 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  45.39 
 
 
415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  47.79 
 
 
414 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  43.83 
 
 
414 aa  341  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  44.27 
 
 
409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  43.61 
 
 
415 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  42.64 
 
 
408 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  40.16 
 
 
418 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  41.6 
 
 
404 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  39.74 
 
 
404 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  40.91 
 
 
407 aa  289  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  39.44 
 
 
460 aa  289  8e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  38.9 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  36.26 
 
 
447 aa  279  7e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  39.38 
 
 
420 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  39.45 
 
 
394 aa  266  5e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  36.5 
 
 
419 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 
418 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  37.41 
 
 
419 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  36.88 
 
 
420 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  38.6 
 
 
414 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  38.34 
 
 
414 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  36.62 
 
 
420 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  36.88 
 
 
421 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  38.52 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  36.68 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  36.68 
 
 
420 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  37.75 
 
 
418 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  36.66 
 
 
421 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  39.64 
 
 
422 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  37.19 
 
 
418 aa  245  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  37.82 
 
 
419 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  35.68 
 
 
417 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  35.68 
 
 
427 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  37.87 
 
 
406 aa  229  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  38 
 
 
422 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  36.36 
 
 
419 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  32.67 
 
 
403 aa  226  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  33.42 
 
 
424 aa  225  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  33.42 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  35.14 
 
 
402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  33.92 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  34.27 
 
 
404 aa  212  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  34.11 
 
 
404 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  33.76 
 
 
403 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  34.11 
 
 
406 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
404 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  33.77 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  31.78 
 
 
388 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  34.38 
 
 
402 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
378 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  30.15 
 
 
340 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  29.94 
 
 
342 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  28.99 
 
 
346 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  29.17 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.38 
 
 
348 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  29.52 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.98 
 
 
346 aa  106  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  27.33 
 
 
341 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  27.68 
 
 
341 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.07 
 
 
429 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.18 
 
 
461 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
342 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  28.26 
 
 
341 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  28.99 
 
 
342 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.14 
 
 
341 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.14 
 
 
429 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  27.37 
 
 
343 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  26.46 
 
 
341 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  27.25 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  26.22 
 
 
341 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  26.56 
 
 
341 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.81 
 
 
439 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0642  6-phosphofructokinase  28.41 
 
 
333 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  27.98 
 
 
341 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.57 
 
 
429 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.13 
 
 
435 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.37 
 
 
444 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.78 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.66 
 
 
450 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.53 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 
341 aa  94.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  31.92 
 
 
360 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  24.13 
 
 
440 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  26.91 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  26.71 
 
 
345 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  27.75 
 
 
343 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.79 
 
 
445 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  27.02 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25 
 
 
448 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  25.07 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  31.4 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  28.11 
 
 
367 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  25.6 
 
 
341 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  27.53 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  28.45 
 
 
362 aa  89.7  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  26.13 
 
 
342 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.91 
 
 
349 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>