More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02589 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  81.58 
 
 
418 aa  662    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  79.14 
 
 
427 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  79.38 
 
 
417 aa  658    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  100 
 
 
418 aa  850    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  62.98 
 
 
421 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  62.74 
 
 
420 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  60.58 
 
 
419 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  60.62 
 
 
419 aa  508  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  61.24 
 
 
420 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  59.62 
 
 
414 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  59.62 
 
 
414 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  60.1 
 
 
418 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  60.82 
 
 
420 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  59.52 
 
 
419 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  57.45 
 
 
420 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  57.45 
 
 
420 aa  481  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  58.23 
 
 
421 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  54.33 
 
 
419 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  55.16 
 
 
418 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  50.24 
 
 
421 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  48.43 
 
 
429 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  47.54 
 
 
407 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  47 
 
 
424 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  52.22 
 
 
422 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  48.64 
 
 
394 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  47.24 
 
 
422 aa  362  8e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  49.05 
 
 
417 aa  356  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  48.28 
 
 
409 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  47.02 
 
 
418 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  45.82 
 
 
415 aa  330  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  45.41 
 
 
415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  43.66 
 
 
414 aa  309  5.9999999999999995e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  43.78 
 
 
415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  40.73 
 
 
414 aa  293  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  37.75 
 
 
400 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  37.5 
 
 
400 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  39.8 
 
 
408 aa  266  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  38.46 
 
 
404 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  38.53 
 
 
447 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  40.9 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  38.26 
 
 
403 aa  250  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  37.68 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  38.21 
 
 
404 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  38.81 
 
 
404 aa  242  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  37.44 
 
 
404 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  37.19 
 
 
402 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  34.18 
 
 
460 aa  238  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  36.82 
 
 
405 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  37.2 
 
 
404 aa  220  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  33.66 
 
 
406 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  35.45 
 
 
378 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  30.51 
 
 
388 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  31.66 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.41 
 
 
348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  28.65 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  32.36 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  29.57 
 
 
344 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  30.66 
 
 
341 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.32 
 
 
346 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  28.85 
 
 
341 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  32.81 
 
 
342 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  33.95 
 
 
341 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  32.76 
 
 
342 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 
341 aa  106  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  28.85 
 
 
370 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  31.25 
 
 
341 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  33.76 
 
 
344 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  25.67 
 
 
340 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.42 
 
 
418 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  27.43 
 
 
341 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  29.63 
 
 
341 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  30.82 
 
 
342 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  28.42 
 
 
373 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.85 
 
 
341 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  29.05 
 
 
367 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.05 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  31.6 
 
 
341 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  29.05 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.52 
 
 
341 aa  97.1  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  29.39 
 
 
360 aa  96.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  28.47 
 
 
339 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  32.13 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  33.01 
 
 
342 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  34.34 
 
 
360 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  33.92 
 
 
343 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  33.92 
 
 
343 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  33.92 
 
 
343 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  25.22 
 
 
343 aa  93.2  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  33.48 
 
 
343 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  34.5 
 
 
343 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  32.2 
 
 
364 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  32.09 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  30.83 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  35.71 
 
 
336 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0550  6-phosphofructokinase  25.5 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000101268  normal  0.239253 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  29.62 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0608  phosphofructokinase  25.17 
 
 
401 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000647644  decreased coverage  0.00336631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  36.57 
 
 
343 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  29.57 
 
 
363 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>