More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2846 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  100 
 
 
421 aa  865    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  72.38 
 
 
420 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  70.95 
 
 
420 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  72.86 
 
 
419 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  70.19 
 
 
414 aa  618  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  70.43 
 
 
414 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  68.33 
 
 
419 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  70.98 
 
 
418 aa  611  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  67.14 
 
 
420 aa  599  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  66.9 
 
 
420 aa  599  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  70.24 
 
 
419 aa  596  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  68.5 
 
 
420 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  69.71 
 
 
421 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  57.8 
 
 
421 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  61.54 
 
 
427 aa  491  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  61.54 
 
 
417 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  62.98 
 
 
418 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  60.34 
 
 
418 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  58.13 
 
 
419 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  56.7 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  59.51 
 
 
422 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  56.55 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  48.91 
 
 
407 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  48.51 
 
 
424 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  46.25 
 
 
418 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  48.26 
 
 
394 aa  373  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  47.86 
 
 
422 aa  363  3e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  44.17 
 
 
415 aa  346  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  45.87 
 
 
409 aa  346  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  47.95 
 
 
417 aa  346  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  44.2 
 
 
415 aa  338  9e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  43.86 
 
 
415 aa  332  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  41.71 
 
 
414 aa  329  5.0000000000000004e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  43.52 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  40 
 
 
404 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  41.18 
 
 
408 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  38.9 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  38.9 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  35.78 
 
 
447 aa  259  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  37.31 
 
 
403 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  37.56 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  37.95 
 
 
404 aa  232  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  36.24 
 
 
404 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  33.04 
 
 
460 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  35.29 
 
 
404 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  34.75 
 
 
406 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  34.83 
 
 
404 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  35.46 
 
 
402 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  34.94 
 
 
405 aa  216  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  32.28 
 
 
406 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  32.73 
 
 
378 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  32.55 
 
 
402 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  31.54 
 
 
388 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  30.55 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  30.79 
 
 
341 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  32.58 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  33.62 
 
 
341 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.18 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  31.82 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  31.14 
 
 
360 aa  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  32.53 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.1 
 
 
346 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  28.65 
 
 
348 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  31.75 
 
 
342 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  31.46 
 
 
370 aa  110  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  33.01 
 
 
367 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  31.06 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
342 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  29.88 
 
 
342 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  30.9 
 
 
341 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  27.93 
 
 
340 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  29.04 
 
 
343 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  30.77 
 
 
342 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  29.84 
 
 
349 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  31.06 
 
 
344 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  29.61 
 
 
341 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  28.96 
 
 
368 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  28.74 
 
 
343 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  28.74 
 
 
343 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  28.74 
 
 
343 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  32.22 
 
 
360 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  33.49 
 
 
345 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  34.86 
 
 
359 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.44 
 
 
341 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  28.8 
 
 
343 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  32.9 
 
 
341 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  29.11 
 
 
341 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  31.03 
 
 
363 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.66 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  29.05 
 
 
343 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  30.39 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  29.82 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  28.41 
 
 
343 aa  96.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0550  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 
401 aa  96.7  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000101268  normal  0.239253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  33.72 
 
 
364 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  29.67 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  28.53 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0608  phosphofructokinase  30.8 
 
 
401 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000647644  decreased coverage  0.00336631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  30.4 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  27.42 
 
 
350 aa  94.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>