More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0355 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  81.75 
 
 
404 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  83 
 
 
404 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  81.84 
 
 
404 aa  692    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  81.05 
 
 
406 aa  683    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  86.25 
 
 
402 aa  735    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  100 
 
 
403 aa  832    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  68.98 
 
 
405 aa  575  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  45.61 
 
 
388 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  42.34 
 
 
415 aa  272  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  39.57 
 
 
418 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  38.37 
 
 
407 aa  259  8e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  43.1 
 
 
415 aa  258  9e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  38.77 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  38.8 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  38.55 
 
 
414 aa  252  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
415 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  39.75 
 
 
404 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  37.71 
 
 
420 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  39.85 
 
 
414 aa  247  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  37.71 
 
 
420 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 
409 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  39.46 
 
 
421 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  37.56 
 
 
421 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  40.9 
 
 
418 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  39.44 
 
 
408 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  40.55 
 
 
418 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  35.09 
 
 
403 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  37.68 
 
 
420 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  38.86 
 
 
414 aa  229  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  35.71 
 
 
419 aa  229  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 
420 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  36.97 
 
 
420 aa  226  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  37.03 
 
 
418 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  36.45 
 
 
417 aa  216  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  36.45 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  36.52 
 
 
419 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  39.33 
 
 
394 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  34.02 
 
 
400 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  33.76 
 
 
400 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  38.76 
 
 
422 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  36.1 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  36.36 
 
 
404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  33.88 
 
 
447 aa  192  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  38.71 
 
 
418 aa  190  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  37.35 
 
 
419 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  35.95 
 
 
417 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  30.23 
 
 
460 aa  183  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  32.23 
 
 
424 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  34.4 
 
 
429 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  37.37 
 
 
422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  32.11 
 
 
378 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  29.82 
 
 
402 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  32.35 
 
 
406 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.87 
 
 
346 aa  92.8  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.25 
 
 
341 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.67 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  28.28 
 
 
342 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  30.85 
 
 
440 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.89 
 
 
444 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.85 
 
 
429 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  27.86 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.89 
 
 
445 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  28.96 
 
 
341 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  28.53 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  28.62 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  28.28 
 
 
342 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.06 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  28.11 
 
 
346 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  27.4 
 
 
343 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  24.62 
 
 
340 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  31.34 
 
 
341 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  25.68 
 
 
341 aa  86.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25 
 
 
437 aa  86.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.32 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  27.3 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  30.17 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  26.44 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  26.59 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.15 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.85 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.9 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.48 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.2 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  26.06 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  27.44 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.65 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  27.1 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.49 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  24.59 
 
 
343 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  27.42 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.05 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  26.58 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.27 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.51 
 
 
437 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  29.33 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  25.08 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  25.82 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  29.22 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.33 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.96 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>