More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0282 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  100 
 
 
419 aa  862    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  72.79 
 
 
421 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  70.17 
 
 
422 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  58.54 
 
 
414 aa  522  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  59.23 
 
 
420 aa  521  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  58.29 
 
 
414 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  59.13 
 
 
420 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  58.13 
 
 
421 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  58.74 
 
 
420 aa  512  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  59.13 
 
 
419 aa  512  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  56.97 
 
 
419 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  56.49 
 
 
419 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  56.97 
 
 
421 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  55.72 
 
 
420 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  56.14 
 
 
418 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  55.72 
 
 
420 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  58.65 
 
 
418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  54.81 
 
 
418 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  50.12 
 
 
429 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  52.88 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  54.33 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  52.88 
 
 
417 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  47.98 
 
 
424 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  45.61 
 
 
407 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  44.97 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  48.8 
 
 
417 aa  334  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  47.5 
 
 
422 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  42.45 
 
 
418 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  45 
 
 
415 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  41.85 
 
 
415 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  41.36 
 
 
414 aa  315  7e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  45.19 
 
 
409 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  42.58 
 
 
415 aa  307  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  40.89 
 
 
414 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  38.48 
 
 
408 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  37.19 
 
 
404 aa  253  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  36.36 
 
 
400 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  36.36 
 
 
400 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  36.19 
 
 
403 aa  242  9e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  33.49 
 
 
447 aa  230  4e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  37.35 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  36.04 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  38.27 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  35.71 
 
 
406 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  32.24 
 
 
460 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  35.63 
 
 
404 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  34.05 
 
 
404 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  34.76 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  32.77 
 
 
406 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  34.62 
 
 
405 aa  189  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  33.59 
 
 
378 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  30.5 
 
 
402 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  31.14 
 
 
388 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  30.16 
 
 
345 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  28.99 
 
 
360 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.94 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  30.81 
 
 
344 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  31 
 
 
370 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  29.09 
 
 
340 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  30.18 
 
 
342 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  30.36 
 
 
341 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29.01 
 
 
340 aa  100  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  31.14 
 
 
341 aa  99.8  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  30.65 
 
 
343 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  30.65 
 
 
343 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  30.65 
 
 
343 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  31.8 
 
 
344 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 
320 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  29.41 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  30.12 
 
 
369 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  29.7 
 
 
343 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  30.25 
 
 
343 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  33.07 
 
 
342 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  30.51 
 
 
365 aa  97.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  33.33 
 
 
341 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  30.34 
 
 
343 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  35.62 
 
 
341 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  28.96 
 
 
341 aa  96.3  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 
320 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  29.11 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  29.78 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  29.45 
 
 
341 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  32.67 
 
 
341 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  32.67 
 
 
342 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  33.7 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  29.25 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  31.46 
 
 
365 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.98 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  29.57 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  31.47 
 
 
341 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  27.19 
 
 
364 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  35.26 
 
 
359 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 
365 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  31.38 
 
 
342 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  27.69 
 
 
344 aa  94  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  28.09 
 
 
345 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  30.12 
 
 
320 aa  93.2  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  27.08 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  31.25 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>