More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0740 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  74.46 
 
 
420 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  77.86 
 
 
418 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  100 
 
 
419 aa  862    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  76.39 
 
 
421 aa  659    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  75.24 
 
 
420 aa  666    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  72.86 
 
 
421 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  70.53 
 
 
420 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  66.35 
 
 
419 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  69.21 
 
 
419 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  66.51 
 
 
414 aa  581  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  66.51 
 
 
414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  63.53 
 
 
420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  63.77 
 
 
420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  59.19 
 
 
427 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  58.95 
 
 
417 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  54.81 
 
 
421 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  60.53 
 
 
418 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  60.62 
 
 
418 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  56.73 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  56.49 
 
 
419 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  55.53 
 
 
422 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  52.18 
 
 
418 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  46.88 
 
 
424 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  48.15 
 
 
407 aa  388  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  48.76 
 
 
394 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  50.12 
 
 
422 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  46.47 
 
 
415 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  46.78 
 
 
417 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  45.3 
 
 
415 aa  339  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  44.47 
 
 
418 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  45.32 
 
 
409 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  44.42 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  43.75 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  42.12 
 
 
414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  39.19 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  40.25 
 
 
408 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  37.41 
 
 
400 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  37.16 
 
 
400 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  38.07 
 
 
403 aa  250  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  35.78 
 
 
447 aa  243  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  36.41 
 
 
406 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  35.71 
 
 
403 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  35.93 
 
 
404 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  35.31 
 
 
404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  38.81 
 
 
404 aa  216  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  34.46 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  34.94 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  36.62 
 
 
405 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  30.63 
 
 
460 aa  202  9e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  32.05 
 
 
406 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  32.71 
 
 
378 aa  160  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 
388 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  30.08 
 
 
402 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  30.99 
 
 
340 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  35.16 
 
 
360 aa  104  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  30.3 
 
 
348 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  33.2 
 
 
370 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  31.61 
 
 
359 aa  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.76 
 
 
346 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  34.15 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  31.25 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  34.29 
 
 
342 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  29.55 
 
 
341 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  36.32 
 
 
364 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  30.14 
 
 
342 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  29.25 
 
 
342 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  31.4 
 
 
346 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.79 
 
 
341 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  33.48 
 
 
368 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  33.49 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  27.55 
 
 
340 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  29.54 
 
 
341 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  34.12 
 
 
362 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  28.87 
 
 
341 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  36.55 
 
 
366 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  35.93 
 
 
341 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  31.94 
 
 
344 aa  88.2  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  28.52 
 
 
341 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  31.05 
 
 
344 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  26.67 
 
 
368 aa  87  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  36.04 
 
 
365 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  29.17 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  34.5 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  30.51 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  33.51 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  28.62 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  34.3 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  33.9 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  28.85 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  29.75 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  29.41 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  32.27 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  34.52 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
365 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  27.85 
 
 
350 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  26.48 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  27.85 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  29.69 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  30.77 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>