More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1502 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 418 aa  859    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  81.6 
 
 		 421 aa  723    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  77.86 
 
 		 419 aa  681    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  83.77 
 
 		 420 aa  743    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  72.51 
 
 		 420 aa  633  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  70.98 
 
 		 421 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  68.99 
 
 		 420 aa  595  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  65.48 
 
 		 419 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  67.87 
 
 		 419 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  66.5 
 
 		 414 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  66.5 
 
 		 414 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  63.79 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  63.55 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  59.13 
 
 		 418 aa  461  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  56.59 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  53.98 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  58.45 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  56.14 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  56.53 
 
 		 417 aa  454  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  56.29 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  53.16 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  52.05 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  49.14 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  49.01 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  44.42 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  50.25 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  45.19 
 
 		 418 aa  336  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  44.84 
 
 		 415 aa  336  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  43.11 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  45.5 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  44.03 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  41.46 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  41.22 
 
 		 408 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  35.57 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  38.56 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  39.46 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  36.24 
 
 		 447 aa  253  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  37.03 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  38.88 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  35.66 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  35.66 
 
 		 404 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  36.25 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  34.94 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  32.41 
 
 		 460 aa  206  8e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  35.42 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  35.01 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  33.81 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  30.67 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  31.68 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.94 
 
 		 346 aa  113  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  30.82 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  31.42 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29.48 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  31.54 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  34.21 
 
 		 349 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  32.22 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  35.35 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  28.57 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  32.86 
 
 		 341 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  33.86 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  30.03 
 
 		 341 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 		 341 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  29.86 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  29.22 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  31.85 
 
 		 342 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  26.73 
 
 		 340 aa  97.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  31.85 
 
 		 341 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  30.14 
 
 		 341 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  31.56 
 
 		 362 aa  96.3  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  35.35 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  29.64 
 
 		 344 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  30.58 
 
 		 368 aa  92.8  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  26.14 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  34.9 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  29.3 
 
 		 344 aa  89.7  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  35.38 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  32.98 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  29.79 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  33.53 
 
 		 341 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  31.22 
 
 		 345 aa  86.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  29.81 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  30.23 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  27.53 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  26.79 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  32.26 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  24.54 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  28.77 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  29.87 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  33.14 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  28.87 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  29.79 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>