More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0681 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1760  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  89.22 
 
 		 401 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.832765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0681  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 		 401 aa  812    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2106  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  66.08 
 
 		 404 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.247023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  67.42 
 
 		 408 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  66.25 
 
 		 403 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2909  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.82 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  64.75 
 
 		 403 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2066  phosphofructokinase  65.91 
 
 		 406 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  64.16 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0150  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  65.06 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1905  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  64.91 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0322067  hitchhiker  0.000281124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  64.16 
 
 		 418 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1438  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  64.82 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15800  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  63.82 
 
 		 407 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  59.05 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55126  PFP pyrophosphate dependent phosphofructokinase  47.19 
 
 		 418 aa  362  9e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  30.12 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.64 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  29.43 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.83 
 
 		 445 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  30.64 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.89 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  27.32 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  30.75 
 
 		 343 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  29.22 
 
 		 341 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  27.65 
 
 		 341 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.24 
 
 		 346 aa  96.3  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  27.48 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.51 
 
 		 439 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.37 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  27.27 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  27.62 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  28.53 
 
 		 344 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  27.4 
 
 		 341 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  25.25 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.09 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  29.3 
 
 		 319 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  28.03 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  28.73 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  29.78 
 
 		 341 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  26.89 
 
 		 348 aa  90.1  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  27.49 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  28.61 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.49 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  27.37 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  27.49 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2519  6-phosphofructokinase  28.73 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  27.43 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  28.2 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  28.53 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  27.61 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  27.03 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  27.44 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  29.17 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.05 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  27.61 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  28.1 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.97 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  33.68 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  27.84 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  27.59 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.69 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.84 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  24.85 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  30.63 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.44 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.97 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.97 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  25.45 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  25.87 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  27.79 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  26.84 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  27.42 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  33.01 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  26.11 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  26.59 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4126  6-phosphofructokinase  27.32 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.82 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  28.29 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  27.31 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  26.61 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  29.86 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  32.2 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0089  6-phosphofructokinase  27.32 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.02 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0088  6-phosphofructokinase  27.32 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  26.8 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  28.02 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  25.38 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  27.68 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  28.96 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  25.92 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>