More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2066  phosphofructokinase  85.26 
 
 		 406 aa  694    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1438  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  85.46 
 
 		 399 aa  696    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  84.62 
 
 		 408 aa  704    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15800  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  100 
 
 		 407 aa  832    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1905  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  77.42 
 
 		 408 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0322067  hitchhiker  0.000281124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  71.18 
 
 		 406 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  70.6 
 
 		 408 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  67 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2106  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  64.82 
 
 		 404 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.247023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2909  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.77 
 
 		 404 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.57 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  64.32 
 
 		 403 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0150  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  65.49 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0681  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.82 
 
 		 401 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1760  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.07 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.832765 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55126  PFP pyrophosphate dependent phosphofructokinase  52.11 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  29.86 
 
 		 343 aa  106  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.27 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.62 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.79 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  27.59 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.49 
 
 		 341 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  27.51 
 
 		 440 aa  96.3  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29.94 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  29.05 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  27.58 
 
 		 341 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  28.53 
 
 		 346 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  27.78 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  24.29 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.74 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  28.29 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  26.5 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  24.08 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  27.65 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.83 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  29.25 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  28.37 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.86 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.14 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  26.7 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.34 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  29.72 
 
 		 341 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  27.48 
 
 		 341 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  31.37 
 
 		 365 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  25 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  28.06 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  27.53 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  25.38 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  25.99 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  30.88 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  28.41 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  28.95 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  25 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  27.9 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  27.9 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  27.9 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  27.3 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  25.67 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  26.3 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  33.17 
 
 		 320 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  24.46 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  29.07 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  28 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  32.68 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  28.41 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  24.46 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  27.4 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  27.99 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  27.53 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  32.2 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  29.48 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  28.79 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  28.25 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  30.43 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  27.69 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  25.21 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  30.73 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  26.88 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  30.92 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  26.55 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  25.33 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  31.75 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  24.93 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70563  6-phosphofructokinase, alpha subunit  30.41 
 
 		 978 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.973256  normal  0.501481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  25.33 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  23.43 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>