More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2869 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  96.03 
 
 
403 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2106  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  82.38 
 
 
404 aa  694    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.247023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2909  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  80.4 
 
 
404 aa  683    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
403 aa  828    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0681  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  66.25 
 
 
401 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1760  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  69.85 
 
 
401 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.832765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2066  phosphofructokinase  63.77 
 
 
406 aa  529  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15800  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  64.32 
 
 
407 aa  525  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  62.78 
 
 
408 aa  518  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  61.94 
 
 
408 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1438  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  61.31 
 
 
399 aa  502  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0150  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  64.81 
 
 
413 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1905  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  60.3 
 
 
408 aa  494  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0322067  hitchhiker  0.000281124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  60.51 
 
 
418 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  58.65 
 
 
406 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55126  PFP pyrophosphate dependent phosphofructokinase  49.01 
 
 
418 aa  358  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  29.39 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.03 
 
 
445 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.41 
 
 
439 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.79 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  29.21 
 
 
343 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.68 
 
 
445 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.67 
 
 
461 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  29.75 
 
 
342 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  25.07 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  26.11 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.15 
 
 
444 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  29.3 
 
 
407 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  26.46 
 
 
342 aa  93.2  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.86 
 
 
437 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29.63 
 
 
340 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.35 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  27.43 
 
 
342 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.75 
 
 
437 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  26.37 
 
 
341 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  27.57 
 
 
341 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  26.91 
 
 
342 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
346 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  26.28 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.41 
 
 
447 aa  87.8  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.32 
 
 
444 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.28 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.46 
 
 
448 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  27.85 
 
 
341 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.93 
 
 
346 aa  86.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.43 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  28.35 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  27.46 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  25.33 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  27.61 
 
 
324 aa  84  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  27.03 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
404 aa  84  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  29.51 
 
 
349 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  26.25 
 
 
341 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  29.41 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  25.84 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  25.69 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  25.47 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  27.93 
 
 
345 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  27.65 
 
 
344 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  27.3 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  24.74 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  27.66 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.93 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  26.01 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  29 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  26.1 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  26.53 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  28.27 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  31.61 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  23.47 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  31.66 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  26.55 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  27.52 
 
 
341 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  25.07 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.19 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  28.46 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  24.59 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  27.33 
 
 
365 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.42 
 
 
429 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  27.1 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  25.07 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  27.03 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  26.96 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  26.91 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  25.66 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  27.57 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  29.11 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  25.76 
 
 
320 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  25.24 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  23.3 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  24.05 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  27.96 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  26.97 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  25.18 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  26.42 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>