111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2164 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  100 
 
 		 537 aa  1081    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  64.02 
 
 		 547 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  54.55 
 
 		 529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  51.33 
 
 		 523 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  51.61 
 
 		 521 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  44.88 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  44.1 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  35.31 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  34.66 
 
 		 367 aa  200  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  36.44 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  36.06 
 
 		 378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  38.35 
 
 		 367 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  37.6 
 
 		 382 aa  178  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  33.7 
 
 		 365 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  36.46 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  36.46 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  35.16 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  34.7 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  30.97 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  31.86 
 
 		 368 aa  156  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  32.78 
 
 		 352 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  27.37 
 
 		 350 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  33.43 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  27.27 
 
 		 353 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  31.59 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  33.7 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  31.34 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  35.06 
 
 		 365 aa  123  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  28.81 
 
 		 423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  38.64 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  39.8 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  31.96 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  26.39 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.4 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  24.83 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  29.7 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  26.94 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  38.89 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  38.89 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  37.78 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.81 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  26.19 
 
 		 498 aa  55.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  41.56 
 
 		 469 aa  54.3  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  37.5 
 
 		 464 aa  53.9  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  28.3 
 
 		 578 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 494 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  24.15 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  37.21 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  40.51 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  33.65 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  36.14 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 493 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  27.57 
 
 		 494 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  35.29 
 
 		 450 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  25.98 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  35.29 
 
 		 450 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  42.86 
 
 		 479 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  27.83 
 
 		 490 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  32.14 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  30 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  30 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  30 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.21 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  30 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  26.49 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  38.82 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  30 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  30.91 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  30 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  29.63 
 
 		 493 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  30 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  22.66 
 
 		 487 aa  48.9  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  36.21 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  35.48 
 
 		 512 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  36 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  30 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  31.87 
 
 		 510 aa  47.8  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  35.8 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  34.44 
 
 		 493 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  42.86 
 
 		 537 aa  47.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  37.8 
 
 		 445 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  34.94 
 
 		 494 aa  47.4  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  28.37 
 
 		 484 aa  47.4  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  34.44 
 
 		 493 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  34.44 
 
 		 493 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  42.59 
 
 		 657 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  32.2 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  29.09 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  29.9 
 
 		 647 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  40.85 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  29.9 
 
 		 647 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  41.67 
 
 		 497 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  37.66 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  34.41 
 
 		 477 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  30.77 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  36.92 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  27.7 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.62 
 
 		 647 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  35.9 
 
 		 624 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>