99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3575 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  100 
 
 		 529 aa  1089    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  63.26 
 
 		 521 aa  668    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  53.4 
 
 		 523 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  54.55 
 
 		 537 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  54.6 
 
 		 547 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  44.07 
 
 		 543 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  44.44 
 
 		 396 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  37.5 
 
 		 361 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  36.83 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  35.23 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  35.96 
 
 		 378 aa  193  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  34.15 
 
 		 365 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  35.28 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  38.53 
 
 		 367 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  30.14 
 
 		 353 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  35.42 
 
 		 382 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  32.11 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  34.17 
 
 		 387 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  31.02 
 
 		 352 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  33.61 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  29.33 
 
 		 350 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  31.56 
 
 		 371 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  33.7 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  33.7 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  33.69 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  31.29 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  31.73 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  29.36 
 
 		 423 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  36.14 
 
 		 365 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  42.42 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  33.1 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  39.56 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  30.45 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  30.42 
 
 		 493 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  30.42 
 
 		 493 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.69 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  27.1 
 
 		 494 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  26.24 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  44.64 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25.39 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  28 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  42.17 
 
 		 457 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 578 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 494 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 		 493 aa  54.3  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  30.16 
 
 		 445 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  43.18 
 
 		 449 aa  53.5  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  35.25 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  39.06 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  27.92 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  29.17 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  30.35 
 
 		 465 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  34.62 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  44.64 
 
 		 479 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  34.41 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  27.99 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  52.73 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  38.2 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  32.97 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  37.04 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  39.66 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  23.59 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  45.45 
 
 		 548 aa  48.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0409  phytoene dehydrogenase-related protein  31.67 
 
 		 465 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  37.21 
 
 		 510 aa  47.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  43.64 
 
 		 536 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  27.78 
 
 		 493 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25.9 
 
 		 445 aa  47  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  33.09 
 
 		 435 aa  47  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  31.52 
 
 		 492 aa  47  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  39.62 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  28.7 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  39.62 
 
 		 485 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  38.96 
 
 		 592 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  39.62 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  39.62 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  39.62 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  39.62 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  26.34 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  34.88 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  27.21 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25.48 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  39.62 
 
 		 490 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  39.62 
 
 		 487 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  39.62 
 
 		 487 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  34.88 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  39.62 
 
 		 487 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  36.59 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  32.76 
 
 		 501 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  43.1 
 
 		 465 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  37.5 
 
 		 469 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.78 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  38.64 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  44.44 
 
 		 542 aa  44.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  38.46 
 
 		 494 aa  44.3  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  38.18 
 
 		 498 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  57.14 
 
 		 624 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  56.41 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  37.93 
 
 		 519 aa  43.5  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>