108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1737 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  63.26 
 
 		 529 aa  696    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  100 
 
 		 521 aa  1051    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  53.88 
 
 		 547 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  51.61 
 
 		 537 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  50.86 
 
 		 523 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  45.79 
 
 		 543 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  47.7 
 
 		 396 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  37.78 
 
 		 367 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  36.16 
 
 		 361 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  36.11 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  36.36 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  36.09 
 
 		 365 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  39.08 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  34.25 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  37.87 
 
 		 382 aa  186  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  35.46 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  35.73 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  35.69 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  34.35 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  34.35 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  33.8 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  31.27 
 
 		 371 aa  146  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  32.7 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  31.16 
 
 		 353 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  31.4 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  29.4 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  37.8 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  31.3 
 
 		 352 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  27.85 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  28.08 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  27.72 
 
 		 493 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  27.72 
 
 		 493 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.72 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  44.57 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.64 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  31.34 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  27.56 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.69 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  37.86 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  43.04 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  30.8 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  24.24 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  25.78 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  25.56 
 
 		 487 aa  57  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  26.64 
 
 		 493 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  26.87 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  27.27 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  27.13 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  29.2 
 
 		 456 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  30.56 
 
 		 436 aa  53.5  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  25.45 
 
 		 464 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  32.35 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  30.77 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  26.1 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  36 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  37.84 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  39.56 
 
 		 498 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  39.56 
 
 		 498 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 		 456 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  33.02 
 
 		 497 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  32 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  28.12 
 
 		 447 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  39.29 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  36.05 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  36.05 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  38.96 
 
 		 421 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25.57 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  29.01 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  45.28 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  26.12 
 
 		 512 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  38.6 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  37.74 
 
 		 487 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  37.74 
 
 		 487 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  23 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  37.8 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  29.55 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  32.94 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  45.45 
 
 		 657 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  35.85 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  24.38 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  47.27 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  33.93 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  37.5 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  42.86 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  27.52 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  37.5 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  37.74 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  35.85 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  35.85 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  41.82 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  35.85 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  35.85 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  35.85 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  35.85 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  40 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  36.9 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>