188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3293 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  100 
 
 		 422 aa  872    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  39.67 
 
 		 427 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  33.26 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  29.83 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  31.95 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  29.36 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  28.88 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  28.57 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  27.01 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.4 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  29.2 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.05 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.84 
 
 		 495 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.57 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  27.92 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  30.73 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  27.18 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.64 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  26.83 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  27.37 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.73 
 
 		 481 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  27.85 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  25.18 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  26.01 
 
 		 628 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  26.42 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  26.68 
 
 		 470 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  30.14 
 
 		 1199 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  25.49 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  27.59 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  27.16 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  33.49 
 
 		 999 aa  80.9  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  24.94 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  29.09 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  28.15 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  25.7 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  25.87 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.77 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  25.86 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  22.98 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  26.68 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.68 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  25.62 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  24.27 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  27.13 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  27.17 
 
 		 1274 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  25.9 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  26.22 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  26.62 
 
 		 625 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  22.2 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  27.11 
 
 		 624 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  25.9 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.34 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.45 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25.54 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  26.3 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  25.44 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  23.77 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  24.76 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  28.42 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.3 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  29.26 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.62 
 
 		 592 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  25.3 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  26.05 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  27.17 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  25.62 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  26.56 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  26.56 
 
 		 616 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  26.8 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  25 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25.16 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  26.87 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  26.34 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  23.37 
 
 		 577 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  28.64 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  23.19 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  23.19 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  23.44 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  23.23 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  23.27 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  27.11 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  22.34 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  23.85 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  25.18 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  25.94 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  22.93 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  25.62 
 
 		 447 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  22.99 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  24.47 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  24.84 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  28.33 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  27.76 
 
 		 352 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  21.57 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  24.47 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  38.96 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  24.89 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.01 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  25.16 
 
 		 523 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  20.91 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>