129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6595 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  100 
 
 		 423 aa  846    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  85.2 
 
 		 422 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  48.9 
 
 		 420 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  46.48 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  44.39 
 
 		 422 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  44.5 
 
 		 415 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  44.16 
 
 		 414 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  44.3 
 
 		 419 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  43.04 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  45.03 
 
 		 456 aa  279  8e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  43.15 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  42.82 
 
 		 422 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  43.16 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  40.9 
 
 		 430 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  40.73 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  40.99 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  40.63 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  39.58 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  36.16 
 
 		 425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  38.19 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  33.86 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  33.76 
 
 		 474 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  34.34 
 
 		 480 aa  143  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  32.57 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  31.15 
 
 		 479 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  34.53 
 
 		 504 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 469 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  33.68 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.05 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  33.09 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  30.71 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  32.26 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  28.08 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.87 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.59 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  31.92 
 
 		 463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  30.93 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  31.67 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  34.9 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  32.46 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  31.79 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  31.81 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.88 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  31.98 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  30.77 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  27.61 
 
 		 470 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  27.21 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  27.25 
 
 		 468 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  30.56 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  25.53 
 
 		 445 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  24.02 
 
 		 481 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  24.48 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  30.71 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  28.15 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.79 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.37 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  28.92 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  30.53 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  28.1 
 
 		 1199 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  27.05 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  22.75 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  27.13 
 
 		 1274 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  31.44 
 
 		 999 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  26 
 
 		 536 aa  66.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  25.06 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  23.97 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  22.71 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  33.33 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  28.03 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.41 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.59 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  40 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  28.47 
 
 		 498 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  28.37 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  28.37 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  29.9 
 
 		 628 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  25.97 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  43.28 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  40.85 
 
 		 431 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.7 
 
 		 549 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1039  electron transfer flavoprotein-ubiquinone dehydrogenase  56.76 
 
 		 553 aa  48.5  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  43.04 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  43.94 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1777  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase precursor  56.76 
 
 		 551 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.964971  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0425  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.85 
 
 		 548 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0424  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.76 
 
 		 551 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  43.55 
 
 		 463 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  30.85 
 
 		 545 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  26.32 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  41.76 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  26.89 
 
 		 600 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2473  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.76 
 
 		 551 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  23.77 
 
 		 577 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  30.53 
 
 		 491 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  56 
 
 		 537 aa  46.6  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 503 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1392  electrotransfer ubiquinone oxidoreductase  54.05 
 
 		 553 aa  46.6  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0942  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.05 
 
 		 554 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>