211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1593 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  100 
 
 		 423 aa  805    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  41.38 
 
 		 407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  40.49 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  37.24 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  36.18 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  30.97 
 
 		 479 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  29.88 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.5 
 
 		 495 aa  107  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.62 
 
 		 436 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  26.07 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.8 
 
 		 495 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  33.33 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  25.6 
 
 		 468 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  32.94 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.89 
 
 		 657 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  34.35 
 
 		 442 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  33.88 
 
 		 1199 aa  87.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  27.81 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  30.14 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  31.12 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  32.31 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  32.64 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  28.45 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  25.47 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.82 
 
 		 628 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  32.71 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  30.81 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  29.77 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  32.69 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  26.28 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  26.58 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  29.45 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  25.7 
 
 		 999 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  32.71 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  31.42 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  27.85 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  29.03 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  25.5 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  27.87 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  29.31 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  29.39 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  32.41 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  33.59 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  26.01 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.81 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  29.15 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  29.07 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  29.07 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  31.71 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  33.73 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  31 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  29.3 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.88 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  29.28 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  28.18 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  29.45 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  30.23 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  30.69 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  30.69 
 
 		 578 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  26.07 
 
 		 498 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  28.85 
 
 		 532 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  26.07 
 
 		 498 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  27.59 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  28.74 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  29.29 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  28.32 
 
 		 625 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  28.16 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  28.11 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  47.37 
 
 		 537 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  26.79 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  31.15 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  26.04 
 
 		 1274 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  33.33 
 
 		 506 aa  53.9  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.51 
 
 		 496 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  29.02 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  36.36 
 
 		 493 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  25.32 
 
 		 492 aa  53.1  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  45.45 
 
 		 492 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  38.89 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  29.88 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  39.39 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.6 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  41.76 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  43.84 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 469 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  27.3 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  42.86 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  23.9 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  38.3 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  24.21 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26.9 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  26.36 
 
 		 485 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  28.68 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  26.99 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  26.52 
 
 		 510 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>