138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1769 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  100 
 
 		 412 aa  821    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  56.81 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  55.61 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  54.85 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  56.3 
 
 		 420 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  53.06 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  52.19 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  44.36 
 
 		 422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  45.72 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  43.7 
 
 		 414 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  45.24 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  42.93 
 
 		 422 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  44.53 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  44.58 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  43.16 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  43.48 
 
 		 413 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  42.49 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  44.03 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  37.8 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  37.56 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  32.67 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  30.83 
 
 		 485 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  31.59 
 
 		 476 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  30.03 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  34.35 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.84 
 
 		 435 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.72 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  34.43 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.56 
 
 		 495 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.84 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  30.66 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.27 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  27.75 
 
 		 463 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.29 
 
 		 436 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.01 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  30.15 
 
 		 476 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  30.02 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  30.1 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  28.54 
 
 		 504 aa  96.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  29.31 
 
 		 442 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  28.54 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  30.23 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  28.01 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  28.96 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  34.34 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.43 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  25.8 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  25.37 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  25.74 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  26.59 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  26.5 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.49 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.44 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  28.61 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  32.42 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  45.35 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  27.55 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  37.5 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  37.14 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  29.49 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  25.5 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  46.55 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  35.43 
 
 		 1274 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  50.91 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  29.51 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  47.27 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  47.37 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  23.06 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  40.48 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.13 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  28.34 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  24.65 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  25.39 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  47.27 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.53 
 
 		 536 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  44.12 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  47.27 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  47.27 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  27.2 
 
 		 1199 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  45.61 
 
 		 537 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  23.18 
 
 		 459 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  27 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  43.75 
 
 		 338 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  24.02 
 
 		 480 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  42.67 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  35.9 
 
 		 628 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  23.89 
 
 		 657 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  45.45 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  27.34 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  47.37 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  25.15 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  33.64 
 
 		 510 aa  47.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  50.85 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  41.18 
 
 		 494 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  46.55 
 
 		 543 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  43.14 
 
 		 493 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  42.31 
 
 		 492 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4341  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  44.64 
 
 		 463 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159082  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  49.02 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>