105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0291 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  100 
 
 		 412 aa  848    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  68.51 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  67.42 
 
 		 397 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  66.5 
 
 		 398 aa  553  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  66.41 
 
 		 399 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  65.32 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  63.04 
 
 		 396 aa  511  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  44.05 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  45.94 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  45.71 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  38.71 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  38.71 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  38.9 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0629  amine oxidase  34.54 
 
 		 405 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  23.14 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  21.21 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  21.21 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.59 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 722 aa  63.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  22.68 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.88 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  22.39 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  22.05 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  21.13 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  22.34 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.41 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  20.52 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  24.88 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  39.71 
 
 		 599 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  20.9 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  20.52 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  21.03 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  20.9 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  21.03 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  26.2 
 
 		 471 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  21.87 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  33.82 
 
 		 552 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  22.08 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  34.88 
 
 		 589 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  32.93 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  22.18 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  36.49 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  32.93 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  39.71 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  35 
 
 		 624 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  35.14 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  38.24 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  35.14 
 
 		 475 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  22.01 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  35.14 
 
 		 479 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  31.03 
 
 		 645 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  21.32 
 
 		 469 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  38.24 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  38.24 
 
 		 474 aa  49.7  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  22.27 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  22.01 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  38.24 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  38.24 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  31.68 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  38.24 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  30.11 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  20.78 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  36.76 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  20.78 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  36.76 
 
 		 465 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.76 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  36.76 
 
 		 462 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  35.14 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  33.75 
 
 		 520 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  20.13 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  36.76 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  30.3 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  30.11 
 
 		 437 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  20.89 
 
 		 435 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  20.78 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  20.78 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  28.24 
 
 		 639 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  26.25 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  29.29 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  21.43 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  36.36 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  20.78 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  29.29 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  21.75 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  21.75 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  21.71 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  29.29 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  20.45 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  27.72 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  23.9 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  21.34 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  30.93 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  47.5 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  19.74 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  29.81 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  25.4 
 
 		 491 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0465  thioredoxin reductase  54.29 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  36.47 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 		 503 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>