More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0465 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0465  thioredoxin reductase  100 
 
 		 305 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2556  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.86 
 
 		 305 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.51858  normal  0.0789528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1203  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 305 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0940141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  41.45 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  41.45 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  40.92 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  40.59 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  41.67 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.87 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  40.85 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  39.02 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  38.87 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.79 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  37.46 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  36.91 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  34.63 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  35.16 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  35.33 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  36.36 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  36.36 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  36.36 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.36 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.36 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  36.36 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  36.04 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  36.36 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  35.29 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  40.45 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  37.87 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  36.13 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.97 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  35.71 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  36.04 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.82 
 
 		 555 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  38.49 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  36.75 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  36.75 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.44 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  37.09 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  41.29 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  37.13 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  38.54 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  36.25 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  36.6 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  37.76 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  39.37 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  38.94 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  38.74 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  33.01 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  38.74 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 409 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  35.45 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.74 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  38.29 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.74 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  38.03 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.74 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.16 
 
 		 548 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  35.62 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  37.86 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  37.86 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  38.98 
 
 		 345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  38.51 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  36.16 
 
 		 555 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  33.99 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2066  thioredoxin reductase (NADPH)  39.93 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  35.33 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  34.38 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  35.76 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.44 
 
 		 551 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.1 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  36.25 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  34.65 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  37.38 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  39.34 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  38.21 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  33.99 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  37.99 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  37.46 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  35.86 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  35.08 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.88 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  35.65 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  36.04 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  34.21 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.73 
 
 		 556 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  37.37 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  37.05 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  33.23 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.57 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  36.48 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  33.86 
 
 		 569 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>