More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2670 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  100 
 
 		 410 aa  837    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.79 
 
 		 403 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0851  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.65 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000113815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  48.84 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.28 
 
 		 407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  49.01 
 
 		 304 aa  299  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 		 394 aa  289  6e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  44.52 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  45.48 
 
 		 318 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  48.21 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  44.34 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  42.05 
 
 		 304 aa  275  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  39.03 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.64 
 
 		 555 aa  270  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  43.42 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  46.5 
 
 		 556 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  43.56 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  42.99 
 
 		 321 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  42.99 
 
 		 321 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  42.99 
 
 		 321 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  42.68 
 
 		 318 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  42.99 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  42.99 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  42.99 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  42.99 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  44.69 
 
 		 308 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  44.88 
 
 		 638 aa  266  7e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  42.04 
 
 		 318 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  42.95 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  44.3 
 
 		 555 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  46.6 
 
 		 331 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 311 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  42.49 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 311 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  45.16 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  41.72 
 
 		 318 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.88 
 
 		 319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  41.88 
 
 		 306 aa  259  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  42 
 
 		 317 aa  257  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  43.05 
 
 		 317 aa  257  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  44.34 
 
 		 310 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  42.95 
 
 		 330 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  42.07 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  43.95 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  42.05 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.98 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  41.12 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  41.78 
 
 		 304 aa  250  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  44.66 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  41.35 
 
 		 309 aa  249  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  43.09 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  42.31 
 
 		 346 aa  249  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  41.72 
 
 		 309 aa  249  8e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  42.86 
 
 		 547 aa  248  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  42.21 
 
 		 310 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  42.31 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.04 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  42.16 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  43.67 
 
 		 321 aa  246  6e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  38.19 
 
 		 308 aa  246  6e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  43.17 
 
 		 329 aa  246  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  44.52 
 
 		 325 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  42.11 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  42.3 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  38.68 
 
 		 340 aa  244  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  43.51 
 
 		 310 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  42.27 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  43.55 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  43.32 
 
 		 327 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  40.98 
 
 		 340 aa  243  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  42.3 
 
 		 320 aa  243  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 325 aa  242  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  46.88 
 
 		 306 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  39.41 
 
 		 306 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  41.16 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  41.16 
 
 		 312 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  41.49 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  41.88 
 
 		 319 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 306 aa  239  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  43.89 
 
 		 304 aa  239  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  40.37 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  42.02 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  42.16 
 
 		 330 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  40.06 
 
 		 552 aa  237  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  42.36 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  39.94 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  41.35 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  39.8 
 
 		 311 aa  236  7e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  43.05 
 
 		 318 aa  236  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  41.81 
 
 		 308 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  40.72 
 
 		 318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  41.16 
 
 		 333 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>