More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  100 
 
 		 552 aa  1131    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  62.05 
 
 		 547 aa  695    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  47.98 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  42.07 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  38.83 
 
 		 569 aa  418  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.16 
 
 		 555 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.36 
 
 		 556 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.4 
 
 		 319 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  40.79 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.3 
 
 		 316 aa  249  7e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.40354  normal  0.494294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.73 
 
 		 427 aa  246  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  41.88 
 
 		 323 aa  240  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  41.91 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  41.91 
 
 		 317 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  41.85 
 
 		 308 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.34 
 
 		 407 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  41.19 
 
 		 310 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  42.58 
 
 		 304 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  41.29 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 311 aa  223  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 312 aa  223  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  38.34 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  41.23 
 
 		 332 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.58 
 
 		 403 aa  220  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  41.75 
 
 		 317 aa  219  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  39.2 
 
 		 340 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.63 
 
 		 326 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  38.78 
 
 		 306 aa  217  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 312 aa  217  5e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  41.35 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  39.25 
 
 		 336 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  39.23 
 
 		 334 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  43.05 
 
 		 304 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  40.06 
 
 		 410 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  39.75 
 
 		 310 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  38.41 
 
 		 308 aa  212  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  39.56 
 
 		 331 aa  213  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  38.32 
 
 		 311 aa  211  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  38.44 
 
 		 310 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  40.75 
 
 		 320 aa  210  6e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  37.85 
 
 		 330 aa  210  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.19 
 
 		 306 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  37.72 
 
 		 333 aa  209  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  37.01 
 
 		 310 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  39.17 
 
 		 308 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 319 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  37.3 
 
 		 306 aa  208  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  37.7 
 
 		 309 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  38.08 
 
 		 319 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 315 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  39.06 
 
 		 309 aa  206  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  39.38 
 
 		 317 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  37.54 
 
 		 317 aa  206  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  38.12 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  37.86 
 
 		 311 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  37.86 
 
 		 311 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 333 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 333 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 333 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  37.22 
 
 		 318 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  40.95 
 
 		 318 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  41.78 
 
 		 306 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 316 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  39.49 
 
 		 311 aa  204  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  41.56 
 
 		 325 aa  203  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  36.71 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  38.51 
 
 		 306 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  38.2 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 318 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  37.66 
 
 		 318 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  37.34 
 
 		 318 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0851  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.89 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000113815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  38.66 
 
 		 311 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  38.51 
 
 		 306 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  37.34 
 
 		 318 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 318 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  38.55 
 
 		 346 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  37.18 
 
 		 321 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  37.18 
 
 		 321 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  37.18 
 
 		 321 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  37.03 
 
 		 318 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  38.06 
 
 		 304 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  39.94 
 
 		 313 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  36.48 
 
 		 326 aa  201  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  38.29 
 
 		 334 aa  200  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  38.3 
 
 		 327 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  42.09 
 
 		 321 aa  199  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  38.34 
 
 		 311 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  39.88 
 
 		 348 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  36.91 
 
 		 310 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  37.34 
 
 		 318 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  34.99 
 
 		 361 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  39.94 
 
 		 362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  37.42 
 
 		 332 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  39.05 
 
 		 311 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  37.93 
 
 		 308 aa  198  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  39.62 
 
 		 324 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  40.65 
 
 		 321 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  39.82 
 
 		 320 aa  197  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>