More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2066 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2066  thioredoxin reductase (NADPH)  100 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  77.74 
 
 		 307 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  72.26 
 
 		 307 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  56.16 
 
 		 310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  60.07 
 
 		 308 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  44.33 
 
 		 306 aa  251  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  42.96 
 
 		 311 aa  251  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  45.14 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  43.99 
 
 		 318 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  43.84 
 
 		 315 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  43.45 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 309 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  41.03 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 340 aa  238  8e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  43.15 
 
 		 318 aa  238  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  41.38 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  43.7 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.89 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.89 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  40.89 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  40.89 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  44.37 
 
 		 396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  42.27 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  40.55 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  40.21 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  42.41 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  41.1 
 
 		 316 aa  231  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  40.71 
 
 		 309 aa  231  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.96 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  41.92 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  43.3 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  42.96 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  39.86 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  40.82 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  42.12 
 
 		 311 aa  228  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  40.97 
 
 		 319 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  41.24 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  38.51 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  39.1 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  40.55 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  41.55 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  41.55 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  38.75 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.55 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  39.38 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  39.38 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  40.62 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  39.8 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  41.92 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  39.73 
 
 		 348 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  40.21 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  39.39 
 
 		 323 aa  218  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 320 aa  218  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  40.41 
 
 		 308 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  38.97 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  40.41 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  37.46 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  39.04 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  41.73 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.51 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  41.16 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  41.02 
 
 		 460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.11 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  41.78 
 
 		 317 aa  212  4.9999999999999996e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  40.56 
 
 		 456 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  39.93 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  40.28 
 
 		 314 aa  211  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  41.75 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  41.3 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  40.54 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  40.14 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  39.58 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  41.98 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  38.83 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  39.58 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  39.31 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  38.1 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  40.14 
 
 		 325 aa  208  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  37.88 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  39.78 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  40.34 
 
 		 453 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  39.46 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  37.93 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  40.75 
 
 		 345 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  36.99 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  39.1 
 
 		 346 aa  205  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  38.89 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  39.93 
 
 		 327 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  38.44 
 
 		 409 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  38.1 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  38.91 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  38.1 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>