130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2115 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 397 aa  818    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  71.72 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  72.22 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  67.09 
 
 		 398 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  67.42 
 
 		 412 aa  560  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  64.8 
 
 		 396 aa  539  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  64.89 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  46.72 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  44.47 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  43.43 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  39.65 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  39.4 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  39.4 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0629  amine oxidase  35.05 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  39.74 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  26.78 
 
 		 467 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  23.6 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  22.17 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  23.13 
 
 		 495 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  22.05 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  23.14 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  33.75 
 
 		 647 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  22.07 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  33.75 
 
 		 647 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  26.03 
 
 		 599 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.34 
 
 		 640 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 		 722 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  33.33 
 
 		 645 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  34.62 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  21.22 
 
 		 454 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.05 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  24.49 
 
 		 624 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  22.32 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.33 
 
 		 642 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.4 
 
 		 639 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 471 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 479 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  38.89 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  30.77 
 
 		 475 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  30.77 
 
 		 475 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  40.85 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  32.5 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.65 
 
 		 643 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  34.21 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  28 
 
 		 639 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  26.92 
 
 		 552 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  37.68 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  29.49 
 
 		 474 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  25.89 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  32.93 
 
 		 589 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2018  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0566522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  29.49 
 
 		 459 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  28 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  30.77 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  29.87 
 
 		 463 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  21.97 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  24.12 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  39.06 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  24.12 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  39.06 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  39.06 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  37.5 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  29.49 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  39.06 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  29.49 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0412  putative oxidoreductase  45.28 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.224421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.51 
 
 		 936 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000976966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  22.08 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  41.86 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  29.49 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  39.06 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  39.06 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  42.62 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  20.9 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  29.49 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  29.49 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  30.77 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  29.49 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  19.91 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  30.4 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 547 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  21.58 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  52.78 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  20.66 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  32.53 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0181  2,4-dienoyl-CoA reductase  22.41 
 
 		 711 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126042 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  29.49 
 
 		 464 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  29.76 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.35 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  44.26 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  29.49 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  52.5 
 
 		 505 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0026  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.78 
 
 		 593 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  23.37 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.35 
 
 		 317 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.71 
 
 		 449 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>