160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1523 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1523  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
402 aa  772    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  38.66 
 
 
434 aa  259  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  35.95 
 
 
436 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  36.43 
 
 
436 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  36.43 
 
 
436 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  36.19 
 
 
436 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  36.43 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  35.38 
 
 
436 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  35.71 
 
 
436 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  35.71 
 
 
436 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  35.24 
 
 
436 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4656  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  29.72 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  24.25 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  38.97 
 
 
456 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  30.73 
 
 
467 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  26.97 
 
 
542 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
435 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  31.01 
 
 
465 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  26.4 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  42.11 
 
 
488 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  26.4 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  26.4 
 
 
468 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  41.18 
 
 
488 aa  53.5  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  26.2 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  32.88 
 
 
465 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  43.66 
 
 
506 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 
361 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  30.51 
 
 
469 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  35.54 
 
 
448 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  28.35 
 
 
245 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  24.19 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.03 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  21.68 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  46.3 
 
 
493 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  37.37 
 
 
447 aa  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  43.21 
 
 
501 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  26.61 
 
 
476 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  34.96 
 
 
420 aa  49.7  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  32.2 
 
 
488 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  31.45 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  27.56 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  41.67 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  23.87 
 
 
485 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  22.34 
 
 
441 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  25 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  27.08 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  25.66 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  39.29 
 
 
519 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  51.02 
 
 
498 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  27.64 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  25.17 
 
 
624 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  24.41 
 
 
501 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  27.64 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90444  Secretory pathway GDP dissociation inhibitor  23.46 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1151  hypothetical protein  22.41 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  32.48 
 
 
490 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  25.95 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  27.54 
 
 
447 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  47.76 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 
531 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  31.51 
 
 
502 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  31.51 
 
 
502 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.19 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  36.26 
 
 
452 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  36.26 
 
 
452 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  25.55 
 
 
410 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  36.26 
 
 
452 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  30.98 
 
 
448 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  22.39 
 
 
436 aa  47  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.64 
 
 
895 aa  47  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  30.14 
 
 
437 aa  47  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  35.14 
 
 
512 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  35.14 
 
 
512 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  35.14 
 
 
512 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  32.28 
 
 
451 aa  46.6  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  28.12 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  28.12 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  28.12 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  46.81 
 
 
997 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  31.17 
 
 
499 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  44.93 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  49.02 
 
 
506 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  30.92 
 
 
479 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  39.39 
 
 
497 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  38.67 
 
 
519 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  40.28 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  65 
 
 
504 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.03 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  22.55 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  27.34 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 
507 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  33.88 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  33.88 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  28.12 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  33.88 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  65.79 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7504  IS3 family transposase  28.46 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  27.34 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>