187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3148 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3148  amine oxidase  100 
 
 
527 aa  1016    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0719859  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
545 aa  200  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
510 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
563 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
565 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
547 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  25.84 
 
 
556 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
564 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
559 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
514 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.36 
 
 
527 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
547 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 
561 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
551 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  31.52 
 
 
545 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 
518 aa  98.2  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  29.03 
 
 
510 aa  95.9  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.19 
 
 
510 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
530 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
516 aa  90.5  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  33.71 
 
 
526 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
534 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
528 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
533 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  26.57 
 
 
530 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
523 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  23.03 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
528 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  28.03 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.64 
 
 
531 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  22.24 
 
 
511 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  26.13 
 
 
529 aa  73.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.41 
 
 
545 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  21.94 
 
 
511 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
522 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
547 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  27.04 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 
537 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  26.77 
 
 
497 aa  67  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
528 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
560 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  24.12 
 
 
512 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
531 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  22.24 
 
 
511 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
523 aa  64.3  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  22.35 
 
 
492 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
521 aa  63.9  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
531 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
523 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
474 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  25.28 
 
 
527 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
506 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.98 
 
 
469 aa  61.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 
468 aa  60.1  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
478 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  26.7 
 
 
519 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  28.6 
 
 
503 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  32.82 
 
 
479 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
530 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
555 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  31.27 
 
 
491 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  24.09 
 
 
504 aa  58.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.68 
 
 
548 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  28.52 
 
 
476 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  24.4 
 
 
498 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.12 
 
 
536 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
549 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
524 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
516 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
520 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
520 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.58 
 
 
503 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  25.71 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  25.21 
 
 
529 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 
474 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  22.05 
 
 
493 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
487 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
484 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
469 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  23.59 
 
 
492 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
520 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  51.85 
 
 
533 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  25.98 
 
 
499 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
476 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  30.98 
 
 
496 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
528 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.07 
 
 
507 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 
524 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
526 aa  51.2  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>