More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6219 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 372 aa  744    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  48.89 
 
 		 367 aa  292  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 377 aa  219  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 371 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.61 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.6 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.16 
 
 		 426 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  35.71 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  35.71 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.27 
 
 		 383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.62 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 371 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.14 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 372 aa  95.9  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  26.52 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  25.72 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  30.87 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.91 
 
 		 857 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 983 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 984 aa  59.7  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.37 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.34 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  31.25 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  31.6 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 		 500 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 460 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  26.5 
 
 		 473 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  27 
 
 		 446 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 496 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 511 aa  53.1  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  36 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.78 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.24 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25.6 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  34.74 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.37 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  49.09 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>