95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5366 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 387 aa  790    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  59.79 
 
 		 407 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  59.79 
 
 		 407 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  36.14 
 
 		 372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  34.96 
 
 		 426 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  35.11 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.75 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.89 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.46 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.81 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.13 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  36.84 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  34.29 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 492 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 375 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 500 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 500 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 496 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.24 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 436 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 364 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  48.94 
 
 		 516 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  32.93 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  42.11 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25.15 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1926  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000171053  normal  0.0881723 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5580  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.67 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  40.58 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  25.56 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 984 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  42.22 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 524 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  30.88 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 983 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  46.51 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  32.61 
 
 		 174 aa  43.1  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 511 aa  43.5  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 428 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  64.52 
 
 		 271 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 435 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 415 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  40.32 
 
 		 433 aa  42.7  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 415 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>