170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2221 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  81.4 
 
 		 267 aa  412  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  56.98 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  57.89 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  58.17 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  58.17 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  57.37 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.58 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  51.75 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  51.75 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  51.75 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.41 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.94 
 
 		 271 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.99 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.67 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.79 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.06 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  43.51 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.31 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.08 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  44.02 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.25 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.11 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.7 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.69 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.29 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.61 
 
 		 254 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  35.25 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.5 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.25 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.69 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  35.94 
 
 		 309 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.36 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.74 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.25 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  32.1 
 
 		 331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  32.01 
 
 		 351 aa  126  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  60 
 
 		 396 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  43.94 
 
 		 493 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  58.54 
 
 		 319 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  35.48 
 
 		 991 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  27.27 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  59.46 
 
 		 399 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  28.05 
 
 		 456 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 		 397 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.7 
 
 		 468 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  30.46 
 
 		 435 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  41.1 
 
 		 556 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40 
 
 		 914 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  56.1 
 
 		 529 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.96 
 
 		 895 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  25 
 
 		 470 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  41.54 
 
 		 382 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 891 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  31.93 
 
 		 459 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  29.76 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  51.16 
 
 		 348 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  57.5 
 
 		 474 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  55 
 
 		 396 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 419 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  30.3 
 
 		 455 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6126  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.07 
 
 		 575 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  33.05 
 
 		 365 aa  45.4  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 434 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  43.55 
 
 		 1150 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1925  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56 
 
 		 561 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0956827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  27.91 
 
 		 504 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  60 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  58.97 
 
 		 568 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  50 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.55 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  31.65 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4398  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  45.45 
 
 		 473 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.07 
 
 		 573 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  31.65 
 
 		 428 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  24.22 
 
 		 494 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  61.11 
 
 		 547 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  31.65 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.64 
 
 		 471 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 432 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  37.14 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  31.65 
 
 		 428 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.07 
 
 		 470 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  37.14 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  55 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.75 
 
 		 449 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.19 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  31.65 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  39.68 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.57 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 431 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.56 
 
 		 468 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  43.1 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  48.98 
 
 		 438 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  43.1 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.15 
 
 		 551 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  59.46 
 
 		 491 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  37.14 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 452 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  48.72 
 
 		 397 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>