160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0859 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  62.45 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  60.94 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  55.81 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  55.13 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  52.33 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  50.2 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.2 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.64 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.11 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.29 
 
 		 286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.22 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.08 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.65 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.84 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.74 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.74 
 
 		 261 aa  214  9e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.36 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.12 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.7 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.31 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.74 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.88 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.06 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.15 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.08 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  43.46 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.06 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.89 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.74 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  36.62 
 
 		 309 aa  152  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.46 
 
 		 308 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  35.56 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.94 
 
 		 307 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.43 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  31.84 
 
 		 331 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  28.92 
 
 		 351 aa  106  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.21 
 
 		 430 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  47.17 
 
 		 396 aa  48.9  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  44.64 
 
 		 409 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.31 
 
 		 435 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  28.57 
 
 		 494 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  60 
 
 		 612 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.44 
 
 		 487 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 		 399 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  59.46 
 
 		 518 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.11 
 
 		 499 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  56.1 
 
 		 396 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  40.79 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  51.52 
 
 		 991 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  40.91 
 
 		 469 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07418  phenol 2-monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13660)  25.97 
 
 		 694 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0355292 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  40.79 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.78 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  41.94 
 
 		 491 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  62.86 
 
 		 609 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  39.68 
 
 		 471 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.76 
 
 		 484 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  41.82 
 
 		 512 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.76 
 
 		 618 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 		 484 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  54.29 
 
 		 997 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  51.43 
 
 		 938 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.74 
 
 		 1073 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.78 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  41.43 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  45.28 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  54.29 
 
 		 617 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.98 
 
 		 551 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  45.28 
 
 		 348 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.78 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.88 
 
 		 914 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  42.86 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  60.53 
 
 		 536 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.34 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.27 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  61.11 
 
 		 547 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  54.76 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35 
 
 		 659 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  38.46 
 
 		 502 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.34 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  62.16 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  54.55 
 
 		 463 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.07 
 
 		 493 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  43.59 
 
 		 413 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  40.91 
 
 		 413 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.3 
 
 		 548 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  38.46 
 
 		 502 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  60.53 
 
 		 559 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0031  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.4 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.07 
 
 		 493 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 		 481 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  29.75 
 
 		 481 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 468 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  49.02 
 
 		 547 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  58.33 
 
 		 392 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  28.07 
 
 		 475 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  58.33 
 
 		 392 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>