More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_02311 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
318 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  96.86 
 
 
318 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  97.48 
 
 
318 aa  645    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.08 
 
 
318 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  82.7 
 
 
318 aa  563  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.04 
 
 
318 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.04 
 
 
318 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76.97 
 
 
317 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  64.47 
 
 
318 aa  444  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  63.92 
 
 
319 aa  427  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1583  thioredoxin-disulfide reductase  62.84 
 
 
297 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.639711  hitchhiker  0.00905635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  44.37 
 
 
313 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  44.97 
 
 
313 aa  264  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  43.09 
 
 
322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0941  Thioredoxin-disulfide reductase  43.22 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
323 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  41.06 
 
 
304 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  38.28 
 
 
308 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  38.69 
 
 
304 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  37.26 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  38.74 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  37.05 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.46 
 
 
306 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  38.21 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  38.06 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  36.86 
 
 
555 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  37.3 
 
 
409 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  36.39 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  37.87 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  37.58 
 
 
638 aa  195  8.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  37.7 
 
 
310 aa  195  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  35.87 
 
 
317 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.36 
 
 
333 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  40.38 
 
 
325 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.36 
 
 
333 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.36 
 
 
333 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  38.31 
 
 
312 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  36.18 
 
 
312 aa  193  4e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  38.66 
 
 
340 aa  192  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  38.11 
 
 
326 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.27 
 
 
407 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  36.21 
 
 
330 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.88 
 
 
325 aa  190  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  37.03 
 
 
320 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  37.03 
 
 
320 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  36.16 
 
 
330 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  37.03 
 
 
320 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  37.29 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  38.24 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.54 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  36.22 
 
 
316 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  35.74 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.73 
 
 
427 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  36.16 
 
 
320 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
348 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  37.46 
 
 
318 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
304 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.55 
 
 
302 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  37.83 
 
 
325 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  34.6 
 
 
318 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  34.81 
 
 
310 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  35.69 
 
 
311 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  35.69 
 
 
311 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  35.18 
 
 
311 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  35.35 
 
 
316 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  36.77 
 
 
311 aa  185  8e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  35.92 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  36.39 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  36.22 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  35.43 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  35.74 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  36.66 
 
 
315 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  37.01 
 
 
310 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  36.27 
 
 
315 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  34.91 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  34.91 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  34.91 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  34.91 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  35.39 
 
 
332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  36.36 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  35.29 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  35.29 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  37.54 
 
 
309 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  36.39 
 
 
453 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  35.83 
 
 
306 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  35.26 
 
 
322 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  35.81 
 
 
318 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  35.85 
 
 
320 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  36.25 
 
 
320 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  36.25 
 
 
320 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  34.2 
 
 
396 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  35.13 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.44 
 
 
556 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  34.75 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  33.87 
 
 
340 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  36.42 
 
 
552 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  34.08 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  34.88 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>