More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1578 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 318 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  99.06 
 
 		 318 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  84.91 
 
 		 318 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  83.91 
 
 		 317 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.04 
 
 		 318 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.36 
 
 		 318 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.67 
 
 		 318 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.36 
 
 		 318 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 		 318 aa  454  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  63.38 
 
 		 319 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1583  thioredoxin-disulfide reductase  63.18 
 
 		 297 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.639711  hitchhiker  0.00905635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  47.04 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  42.45 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  45.02 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0941  Thioredoxin-disulfide reductase  44.03 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  40 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  38.82 
 
 		 638 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  38.82 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  37.7 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  35.81 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  36.57 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  37.86 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.49 
 
 		 333 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.49 
 
 		 333 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.49 
 
 		 333 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  37.7 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  38.31 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  36.51 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.69 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  36.89 
 
 		 555 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  37.7 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  36.6 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.26 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  36.01 
 
 		 409 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  35.46 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  38.56 
 
 		 326 aa  191  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  35.37 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  36.16 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.28 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  35.5 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  35.62 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  36.21 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  34.29 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  34.22 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  35.18 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  34.74 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  35.97 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  34.64 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  34.21 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.43 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  38.28 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  39.03 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  36.54 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  35.13 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  36.84 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  34.82 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  34.82 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  35.06 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  36.04 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  35.16 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  36.21 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  35.1 
 
 		 348 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  36.21 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.21 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.21 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  36.21 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  36.21 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  36.21 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  36.21 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  35.58 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  35.1 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  33.76 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  36.21 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  35.03 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  33.99 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.42 
 
 		 556 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  34.63 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  33.97 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  35.33 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  34.87 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  35.22 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  35.33 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  34.65 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.66 
 
 		 407 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  35.39 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  34.74 
 
 		 547 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  34.39 
 
 		 453 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  36.72 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  35 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  34.3 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  33.99 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  35.96 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  33.77 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  34.52 
 
 		 320 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  35.31 
 
 		 311 aa  175  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  34.41 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  33.44 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>