More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0901 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 313 aa  633  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  60.7 
 
 		 313 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0941  Thioredoxin-disulfide reductase  62.62 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.53 
 
 		 318 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.38 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.38 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.37 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  45.11 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.16 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.61 
 
 		 318 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.55 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.45 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  42.31 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  45.16 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1583  thioredoxin-disulfide reductase  39.53 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.639711  hitchhiker  0.00905635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  39.74 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  39.07 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  37.18 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.64 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.64 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.64 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.53 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  37.75 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  39.22 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  36.93 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  36.39 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  39.41 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  37.46 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  37.78 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  37.18 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  36.6 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.62 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 346 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  38.74 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  36.6 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  36.96 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  38.49 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  36.25 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  39.22 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  36.04 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  37.29 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  38.76 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  38.22 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  36.48 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  36.3 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  35.71 
 
 		 409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  38.56 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  37.79 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  37.1 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  38.16 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  35.53 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  38.78 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  35.83 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.91 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  37.74 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  36.66 
 
 		 321 aa  178  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  36.18 
 
 		 318 aa  178  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  35.06 
 
 		 638 aa  178  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  36.39 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  37.62 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  35.71 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  36.18 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.29 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  37.29 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  36.07 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  35.86 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  37.87 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  36.81 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  36.77 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  37.01 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  39.8 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  36.57 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  37.62 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  38.74 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  35.95 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  36.54 
 
 		 348 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  35.74 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  36.93 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  35.86 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  38.54 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  33.44 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.39 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  37.13 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  36.96 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.39 
 
 		 555 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  36.08 
 
 		 361 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  34.97 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  36.93 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  33.65 
 
 		 552 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  36.88 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  36.62 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  36.57 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  35.16 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  36.48 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  34.42 
 
 		 547 aa  169  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>