More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1451 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  100 
 
 
322 aa  654    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  45.81 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0941  Thioredoxin-disulfide reductase  48.06 
 
 
313 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.02 
 
 
318 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.02 
 
 
318 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.99 
 
 
318 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  41.8 
 
 
319 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  45.16 
 
 
313 aa  263  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.09 
 
 
318 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.31 
 
 
317 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.09 
 
 
318 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  42.86 
 
 
318 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.8 
 
 
318 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.51 
 
 
318 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1583  thioredoxin-disulfide reductase  41.89 
 
 
297 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.639711  hitchhiker  0.00905635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  40.45 
 
 
308 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  39.55 
 
 
409 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
332 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
312 aa  225  7e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  40.07 
 
 
335 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  39.49 
 
 
336 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  41.39 
 
 
304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.16 
 
 
325 aa  220  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  38.22 
 
 
331 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  43.77 
 
 
318 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
306 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  43.23 
 
 
318 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  39.14 
 
 
306 aa  216  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  40.32 
 
 
311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  38.94 
 
 
306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  43.09 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  43.09 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  43.09 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.09 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.09 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  43.09 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  43.09 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  41.9 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
310 aa  212  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  41.9 
 
 
318 aa  212  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  37.62 
 
 
330 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
310 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
318 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  40.83 
 
 
304 aa  208  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  40.72 
 
 
315 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  38.49 
 
 
308 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  35.58 
 
 
330 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  39.02 
 
 
302 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  40.32 
 
 
325 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  38.69 
 
 
319 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  35.83 
 
 
304 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  36.81 
 
 
309 aa  205  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  37.91 
 
 
310 aa  205  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  38.31 
 
 
333 aa  205  9e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  40.62 
 
 
318 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.45 
 
 
427 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  38.94 
 
 
396 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  37.58 
 
 
312 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
331 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  36.93 
 
 
359 aa  202  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  39.18 
 
 
340 aa  202  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  38.56 
 
 
321 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
327 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  36.75 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  36.07 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  36.77 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  36.6 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  37.38 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.57 
 
 
305 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  40.87 
 
 
340 aa  199  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  36.94 
 
 
318 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  37.54 
 
 
555 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  37.13 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  37.83 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  36.72 
 
 
334 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  36.36 
 
 
353 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.46 
 
 
403 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  35.76 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  37.7 
 
 
318 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.27 
 
 
306 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  37.06 
 
 
317 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  37.17 
 
 
332 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  37.26 
 
 
327 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
329 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  37.38 
 
 
344 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  36.25 
 
 
346 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  36.6 
 
 
325 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  38 
 
 
308 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  37.99 
 
 
311 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  37.17 
 
 
319 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  39.49 
 
 
410 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  35.16 
 
 
310 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  38.59 
 
 
316 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  37.17 
 
 
311 aa  192  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  41.25 
 
 
321 aa  192  8e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  37.3 
 
 
313 aa  192  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  36.81 
 
 
310 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>