More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_02401 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
318 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.08 
 
 
318 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.71 
 
 
318 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.4 
 
 
318 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  82.39 
 
 
318 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.36 
 
 
318 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.04 
 
 
318 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76.03 
 
 
317 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  63.21 
 
 
318 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  62.97 
 
 
319 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1583  thioredoxin-disulfide reductase  63.18 
 
 
297 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.639711  hitchhiker  0.00905635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  46.54 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  44.55 
 
 
313 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  40.51 
 
 
322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0941  Thioredoxin-disulfide reductase  42.59 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  38.49 
 
 
323 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  39 
 
 
304 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.93 
 
 
407 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  36.88 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  38.82 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  38.06 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  36.39 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
318 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  36.72 
 
 
319 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  36.66 
 
 
409 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  37.17 
 
 
638 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  37.66 
 
 
312 aa  192  4e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  36.57 
 
 
306 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  36.07 
 
 
308 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.11 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  37.22 
 
 
315 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  37.38 
 
 
340 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  35.44 
 
 
555 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  35.44 
 
 
310 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.18 
 
 
306 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  35.29 
 
 
310 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  34.91 
 
 
317 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  39.62 
 
 
325 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  36.81 
 
 
311 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  36.66 
 
 
316 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  36.07 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  36.39 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  38.11 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  35.69 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  34.53 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  35.69 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.25 
 
 
310 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.73 
 
 
427 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  36.62 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  35.62 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  34.73 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  34.45 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  35.14 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  36.18 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  36.25 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  36.18 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  36.18 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  35.88 
 
 
331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  36.13 
 
 
306 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  33.77 
 
 
309 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  35.28 
 
 
313 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  36.69 
 
 
318 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  34.89 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  35.44 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  34.89 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  35.43 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  34.89 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  35.44 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  34.89 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  35.44 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  33.86 
 
 
318 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  36.89 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  36.39 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  36.27 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  33.89 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  36.45 
 
 
348 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  34.16 
 
 
320 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  34.53 
 
 
330 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  34.27 
 
 
320 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  35.83 
 
 
320 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  34.87 
 
 
306 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  35.83 
 
 
320 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  34.2 
 
 
306 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  35.62 
 
 
318 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  36.04 
 
 
310 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.11 
 
 
556 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  36.93 
 
 
308 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  35.78 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  35.78 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  35.06 
 
 
311 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  34.57 
 
 
320 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  36.16 
 
 
318 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  36.04 
 
 
318 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>