181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0421 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 271 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  68.58 
 
 		 268 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  60.94 
 
 		 259 aa  308  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.9 
 
 		 258 aa  278  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  56.25 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  52.94 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.02 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.02 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.34 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.61 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.24 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.61 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.22 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.94 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.58 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  47.94 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.29 
 
 		 263 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.42 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.61 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50 
 
 		 248 aa  215  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.6 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.22 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.89 
 
 		 275 aa  211  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.45 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.62 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.31 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.08 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.4 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.2 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  36.65 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  36.43 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.83 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.33 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.28 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.44 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  32.97 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  34.31 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  46.15 
 
 		 469 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  41.79 
 
 		 472 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.16 
 
 		 653 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.16 
 
 		 653 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.16 
 
 		 653 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.11 
 
 		 895 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.16 
 
 		 653 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 891 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  41.79 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  41.79 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  41.79 
 
 		 641 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  31.29 
 
 		 494 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  40.3 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  41.79 
 
 		 644 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  58.54 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  42.31 
 
 		 473 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  40.3 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  41.79 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  41.79 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  41.79 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  40.3 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  40.3 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  40.32 
 
 		 396 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  47.22 
 
 		 991 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  37.68 
 
 		 472 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  50.98 
 
 		 512 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  40 
 
 		 472 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.16 
 
 		 653 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  36.11 
 
 		 472 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  34.25 
 
 		 612 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.88 
 
 		 674 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  38.81 
 
 		 472 aa  45.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  43.86 
 
 		 653 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  34.72 
 
 		 483 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.07 
 
 		 659 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  56.76 
 
 		 518 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.88 
 
 		 674 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.88 
 
 		 667 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  40.35 
 
 		 659 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  60 
 
 		 617 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  58.54 
 
 		 1150 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.39 
 
 		 671 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.07 
 
 		 659 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40 
 
 		 652 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.39 
 
 		 671 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  39.39 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  39.39 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  34.07 
 
 		 659 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.67 
 
 		 546 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.07 
 
 		 659 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  37.68 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  36.23 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  37.33 
 
 		 504 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  37.68 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  39.39 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.88 
 
 		 658 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  53.19 
 
 		 612 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  34.72 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  39.39 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  34.07 
 
 		 659 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  38.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  37.68 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>