205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2426 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  65.12 
 
 		 264 aa  316  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  55.81 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.76 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  56.2 
 
 		 286 aa  267  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  55.43 
 
 		 258 aa  261  8e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.75 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  52.94 
 
 		 254 aa  258  9e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.9 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.54 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  56.59 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.51 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.08 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.41 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.02 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.39 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.27 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.39 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  46.15 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.85 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.33 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.06 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.98 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.09 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.77 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.77 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.26 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.77 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.15 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.65 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  34.86 
 
 		 310 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  34.98 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.96 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.92 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  32.87 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  33.45 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  33.33 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.29 
 
 		 430 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  46.03 
 
 		 487 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.62 
 
 		 492 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  26.92 
 
 		 416 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  46.03 
 
 		 488 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  44.44 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 		 518 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.44 
 
 		 776 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  44.44 
 
 		 487 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  51.06 
 
 		 463 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  44.44 
 
 		 492 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  44.44 
 
 		 477 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  42.86 
 
 		 491 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  46.03 
 
 		 491 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  65.71 
 
 		 488 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2165  glutamate synthase subunit beta  41.43 
 
 		 513 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  42.86 
 
 		 492 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  44.44 
 
 		 488 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  39.68 
 
 		 485 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2257  glutamate synthase subunit beta  41.43 
 
 		 513 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000664143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  36.49 
 
 		 472 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  36.07 
 
 		 422 aa  45.4  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  43.4 
 
 		 479 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  62.86 
 
 		 488 aa  45.4  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  24.28 
 
 		 557 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  42.86 
 
 		 487 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  56.41 
 
 		 513 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.22 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  46.03 
 
 		 489 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  46.15 
 
 		 484 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  36.05 
 
 		 484 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0819  glutamate synthase subunit beta  48.57 
 
 		 484 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50.98 
 
 		 462 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  65.71 
 
 		 484 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  42.11 
 
 		 512 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  39.68 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3148  amine oxidase  58.97 
 
 		 527 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0719859  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  44.44 
 
 		 492 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  62.86 
 
 		 491 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  43.75 
 
 		 572 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  44.44 
 
 		 488 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.71 
 
 		 434 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  41.27 
 
 		 480 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  52.27 
 
 		 653 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  44.62 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  42.86 
 
 		 485 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.15 
 
 		 612 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 		 489 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  44.44 
 
 		 488 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  32 
 
 		 434 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.55 
 
 		 485 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  62.16 
 
 		 502 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 		 489 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  36.99 
 
 		 489 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  38.1 
 
 		 491 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.97 
 
 		 641 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  62.16 
 
 		 502 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.96 
 
 		 499 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.97 
 
 		 639 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 526 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  42.86 
 
 		 478 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>