197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1498 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  89.66 
 
 		 261 aa  455  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  84.47 
 
 		 273 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  82.38 
 
 		 259 aa  424  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  64.06 
 
 		 263 aa  330  2e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  62.15 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  57.89 
 
 		 271 aa  289  4e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.19 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.02 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  47.84 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.27 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.21 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.59 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.89 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.85 
 
 		 263 aa  211  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.69 
 
 		 260 aa  205  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.74 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.6 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.83 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.92 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.98 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  46.3 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.02 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.86 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.98 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.58 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.86 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.81 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.67 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  37.37 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  37.02 
 
 		 309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.59 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.21 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.81 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  30.5 
 
 		 351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  29.39 
 
 		 331 aa  99  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  31.34 
 
 		 422 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  31.85 
 
 		 420 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  42.11 
 
 		 997 aa  49.7  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  29.25 
 
 		 399 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  51.02 
 
 		 470 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  58.54 
 
 		 469 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  56.1 
 
 		 529 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.46 
 
 		 914 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 891 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.72 
 
 		 895 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  38.46 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  29.63 
 
 		 420 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0192  2,4-dienoyl-CoA reductase  37.25 
 
 		 677 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.804371  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1367  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  37.25 
 
 		 677 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1562  2,4-dienoyl-CoA reductase  37.25 
 
 		 677 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2719  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  37.25 
 
 		 677 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2575  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  37.25 
 
 		 677 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0222  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  37.25 
 
 		 677 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.22 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  36.36 
 
 		 670 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  46.67 
 
 		 1075 aa  46.6  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0995  2,4-dienoyl-CoA reductase  37.25 
 
 		 677 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  27.65 
 
 		 409 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  54.35 
 
 		 429 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63640  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  36.05 
 
 		 681 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.771531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  46.94 
 
 		 472 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  54.35 
 
 		 429 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  54.35 
 
 		 429 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 419 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  29.32 
 
 		 435 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  28.79 
 
 		 424 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 536 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  52.17 
 
 		 429 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5533  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  36.05 
 
 		 681 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  48.39 
 
 		 518 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  43.55 
 
 		 487 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.46 
 
 		 677 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  32.58 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.5 
 
 		 612 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 		 536 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.86 
 
 		 681 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6126  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44 
 
 		 575 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  42.19 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  39.62 
 
 		 991 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  40 
 
 		 504 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  47.92 
 
 		 427 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  52.5 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.54 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  58.97 
 
 		 552 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  27.7 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  53.66 
 
 		 511 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  29.32 
 
 		 435 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  60.53 
 
 		 462 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  27.7 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  39.13 
 
 		 476 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.54 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  35.06 
 
 		 670 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  65.71 
 
 		 493 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  31.4 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.54 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  45.59 
 
 		 616 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  29.37 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>