55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2100 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  71.21 
 
 		 258 aa  368  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  63.32 
 
 		 286 aa  334  7.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.51 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.7 
 
 		 254 aa  254  9e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.09 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  53.67 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.91 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.11 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.24 
 
 		 271 aa  231  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  52.14 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.08 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.47 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.29 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.69 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.48 
 
 		 275 aa  206  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.7 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.31 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.29 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.21 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.92 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.53 
 
 		 248 aa  191  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.8 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  42.06 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.75 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.01 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.46 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.79 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.57 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.85 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.91 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.91 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  37.14 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.57 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  37.01 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  30.04 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  32.46 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  48.33 
 
 		 647 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.76 
 
 		 1487 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 518 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  42.03 
 
 		 612 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  36.23 
 
 		 1075 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.23 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 516 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 399 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.15 
 
 		 612 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  27.37 
 
 		 407 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  43.33 
 
 		 648 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.62 
 
 		 648 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.74 
 
 		 617 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60 
 
 		 677 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.08 
 
 		 463 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.55 
 
 		 658 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.3 
 
 		 1073 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.14 
 
 		 608 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>