154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0663 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 
261 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  91.19 
 
 
261 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  91.12 
 
 
262 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  90.42 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  73.15 
 
 
263 aa  361  8e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.58 
 
 
271 aa  236  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  51.16 
 
 
267 aa  234  8e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.49 
 
 
268 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.58 
 
 
271 aa  225  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.08 
 
 
259 aa  225  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.33 
 
 
258 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.48 
 
 
263 aa  215  7e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.21 
 
 
275 aa  214  8e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.43 
 
 
273 aa  206  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.45 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.85 
 
 
261 aa  203  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.67 
 
 
259 aa  202  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.67 
 
 
286 aa  202  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.1 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.71 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  42.8 
 
 
264 aa  196  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.21 
 
 
260 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.36 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.19 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  44.96 
 
 
254 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.31 
 
 
258 aa  178  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.63 
 
 
248 aa  168  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.23 
 
 
248 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.39 
 
 
277 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  36.07 
 
 
310 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  35.71 
 
 
309 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.72 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.17 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.74 
 
 
307 aa  138  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.66 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  29.51 
 
 
351 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  29 
 
 
331 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.35 
 
 
555 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.59 
 
 
425 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.93 
 
 
545 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.33 
 
 
430 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  28.12 
 
 
377 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30 
 
 
539 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  28.98 
 
 
453 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.57 
 
 
570 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.5 
 
 
430 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 
431 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.08 
 
 
544 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  28.04 
 
 
434 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  34.12 
 
 
544 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  53.06 
 
 
512 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  30.61 
 
 
435 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.78 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.78 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.22 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  50.98 
 
 
433 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.59 
 
 
1073 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
430 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  56.41 
 
 
529 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  36.9 
 
 
539 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.29 
 
 
539 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  39.19 
 
 
539 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 
499 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  44.07 
 
 
436 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.34 
 
 
318 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  27.44 
 
 
456 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  56.1 
 
 
463 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  37.5 
 
 
563 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  58.97 
 
 
326 aa  45.4  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.03 
 
 
394 aa  45.4  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  41.18 
 
 
563 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  52.38 
 
 
462 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
431 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  41.18 
 
 
563 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  39.71 
 
 
560 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3262  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.43 
 
 
687 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
430 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.78 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.45 
 
 
551 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
471 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  34.04 
 
 
384 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  26.51 
 
 
454 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
479 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1486  glutamate synthase, small subunit  34.44 
 
 
452 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.622168  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 
430 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  38.24 
 
 
563 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  53.49 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  46.94 
 
 
470 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55 
 
 
415 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.372109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
547 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  37.04 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.77 
 
 
407 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  38.46 
 
 
427 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  58.82 
 
 
543 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  55 
 
 
412 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  39.34 
 
 
399 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  57.89 
 
 
436 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  55.88 
 
 
490 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 
531 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  36.71 
 
 
547 aa  43.9  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>