55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2109 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  71.21 
 
 		 260 aa  368  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  65.89 
 
 		 286 aa  340  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  55.43 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  56.59 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  55.98 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.05 
 
 		 268 aa  258  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  54.33 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.7 
 
 		 254 aa  252  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.02 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  53.49 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.03 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.95 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.27 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.79 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.84 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.24 
 
 		 261 aa  215  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.27 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.49 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  45.24 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.1 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.76 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.64 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.92 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.1 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.53 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.1 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.1 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.02 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.72 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  36.65 
 
 		 309 aa  168  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.28 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  36.43 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.74 
 
 		 307 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.35 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  30.34 
 
 		 351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  31.6 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 518 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.1 
 
 		 646 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  54.55 
 
 		 512 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.54 
 
 		 612 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 534 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2708  putative opine oxidase subunit a  45.28 
 
 		 472 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1067  putative glutamate synthase (NADPH)  27.59 
 
 		 597 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 516 aa  42.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 		 402 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.67 
 
 		 647 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  28.34 
 
 		 599 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  58.33 
 
 		 392 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  34.25 
 
 		 471 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  58.33 
 
 		 392 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  47.37 
 
 		 997 aa  42.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  30.95 
 
 		 529 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.2 
 
 		 444 aa  42.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  32.88 
 
 		 470 aa  42  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>