130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0678 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.08 
 
 
309 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.82 
 
 
307 aa  255  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  48.07 
 
 
309 aa  254  9e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  48.25 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.12 
 
 
308 aa  253  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.97 
 
 
260 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.37 
 
 
254 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.89 
 
 
248 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.49 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.61 
 
 
286 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.86 
 
 
275 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.83 
 
 
271 aa  159  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.74 
 
 
259 aa  158  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.69 
 
 
259 aa  157  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.92 
 
 
261 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.55 
 
 
263 aa  156  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.78 
 
 
254 aa  155  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.35 
 
 
258 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.3 
 
 
273 aa  155  6e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.25 
 
 
268 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.52 
 
 
263 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  37.2 
 
 
254 aa  153  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  34.53 
 
 
331 aa  152  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.96 
 
 
258 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.41 
 
 
255 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.25 
 
 
271 aa  149  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  36.43 
 
 
264 aa  148  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  36.68 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.19 
 
 
256 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  31.42 
 
 
351 aa  142  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.25 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.66 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.2 
 
 
277 aa  132  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.19 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.19 
 
 
261 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.72 
 
 
262 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25 
 
 
444 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  30.36 
 
 
435 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  37.63 
 
 
530 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2101  monooxygenase FAD-binding protein  53.85 
 
 
368 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1545  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.33 
 
 
365 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0160439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  51.22 
 
 
463 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  33.33 
 
 
510 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  31.9 
 
 
448 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.22 
 
 
519 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  41.67 
 
 
447 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  48.39 
 
 
558 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 
456 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  46.34 
 
 
462 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2704  putative FAD-binding dehydrogenase  33.33 
 
 
582 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.900801  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
468 aa  47  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0381  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55 
 
 
700 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  46.81 
 
 
1075 aa  46.6  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  31.71 
 
 
527 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  34.94 
 
 
435 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.42 
 
 
425 aa  46.2  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  32.63 
 
 
572 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  32.65 
 
 
535 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  35.71 
 
 
557 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  34.25 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  41.94 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
431 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  51.22 
 
 
456 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  51.06 
 
 
479 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2183  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.13 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0714884  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2553  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.13 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.541648  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  43.75 
 
 
492 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  51.28 
 
 
419 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.47 
 
 
468 aa  44.3  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.89 
 
 
467 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.2 
 
 
683 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
511 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
430 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  25.38 
 
 
454 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2214  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.22 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.014597  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  36.99 
 
 
484 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1531  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  52.78 
 
 
409 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  32.43 
 
 
431 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  21.68 
 
 
432 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 
455 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.18 
 
 
1016 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.66 
 
 
465 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2851  sarcosine oxidase alpha subunit  62.16 
 
 
411 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2442  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  62.16 
 
 
411 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0124928  normal  0.797944 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  37.23 
 
 
174 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  42.86 
 
 
612 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  48.72 
 
 
464 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  43.14 
 
 
446 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  43.14 
 
 
446 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  31.25 
 
 
578 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  44.64 
 
 
511 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 
471 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.62 
 
 
474 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  45.65 
 
 
560 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.32 
 
 
557 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  35.8 
 
 
394 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
545 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.54 
 
 
571 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2150  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.24 
 
 
563 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.357931 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>