199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3243 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  928    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  42.92 
 
 
445 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.07 
 
 
472 aa  285  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  36.95 
 
 
464 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  37.44 
 
 
466 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 
423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  36.82 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 
475 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 
457 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
457 aa  240  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  36.73 
 
 
435 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  33.08 
 
 
478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  32.16 
 
 
431 aa  234  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  31.75 
 
 
491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.98 
 
 
459 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  31.86 
 
 
444 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
453 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
443 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  27.97 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
457 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.07 
 
 
461 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  29.68 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  31.1 
 
 
432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  30.43 
 
 
459 aa  172  9e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
441 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  29.31 
 
 
672 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.71 
 
 
600 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  31.03 
 
 
465 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  30.73 
 
 
457 aa  156  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
421 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  30.77 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.87 
 
 
606 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  30.24 
 
 
483 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  27.87 
 
 
624 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
468 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 
462 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
455 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
460 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.47 
 
 
618 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  29.93 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  25.53 
 
 
421 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
441 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  28.26 
 
 
437 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.86 
 
 
722 aa  120  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  28.54 
 
 
758 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  27.45 
 
 
764 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  26.44 
 
 
757 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.9 
 
 
600 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
483 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  27.6 
 
 
763 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  27.47 
 
 
764 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.46 
 
 
641 aa  99.8  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  26.24 
 
 
748 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  27.09 
 
 
797 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.27 
 
 
582 aa  94.4  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  25.52 
 
 
625 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  23.21 
 
 
599 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  23.49 
 
 
595 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  24.7 
 
 
584 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.9 
 
 
584 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  38.4 
 
 
531 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  31.77 
 
 
550 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  28.57 
 
 
761 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  23.49 
 
 
619 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  33.33 
 
 
669 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  25.99 
 
 
680 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  23.45 
 
 
784 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  30.56 
 
 
706 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  24.02 
 
 
585 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  24.48 
 
 
514 aa  56.6  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  30.82 
 
 
668 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  38.67 
 
 
303 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  25.29 
 
 
549 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  25.65 
 
 
595 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  26.32 
 
 
543 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  66.67 
 
 
424 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  30.5 
 
 
547 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  41.1 
 
 
395 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  31.2 
 
 
530 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  63.16 
 
 
427 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  40.45 
 
 
174 aa  50.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  21.21 
 
 
621 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
676 aa  49.7  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  50 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  28.27 
 
 
595 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  30.56 
 
 
696 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  30.56 
 
 
696 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.52 
 
 
519 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
538 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  28.79 
 
 
660 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  36.78 
 
 
525 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  56.41 
 
 
1000 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>