More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1998 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 
273 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  94.25 
 
 
259 aa  471  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  86.97 
 
 
261 aa  449  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  84.47 
 
 
275 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  62.3 
 
 
263 aa  316  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  59.68 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  58.17 
 
 
271 aa  278  5e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  51.5 
 
 
286 aa  229  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  47.08 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.84 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.27 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.22 
 
 
268 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.29 
 
 
260 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.43 
 
 
261 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.88 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.08 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.53 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.45 
 
 
254 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.19 
 
 
261 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.43 
 
 
262 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.4 
 
 
261 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.88 
 
 
263 aa  191  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.63 
 
 
256 aa  189  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  46.72 
 
 
254 aa  188  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.8 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.95 
 
 
248 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.69 
 
 
248 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.22 
 
 
307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  37.54 
 
 
310 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  37.89 
 
 
309 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.3 
 
 
272 aa  156  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.75 
 
 
308 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.74 
 
 
277 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.3 
 
 
309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.22 
 
 
258 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  30.85 
 
 
351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  28.63 
 
 
331 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  31.36 
 
 
422 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  38.24 
 
 
580 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63640  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  36.05 
 
 
681 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.771531  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1799  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.08 
 
 
681 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.921787  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5533  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  37.21 
 
 
681 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 
431 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.57 
 
 
677 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.51 
 
 
458 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  28.4 
 
 
494 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  39.6 
 
 
484 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  44 
 
 
448 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  45.61 
 
 
997 aa  50.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  27.65 
 
 
420 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.44 
 
 
492 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.02 
 
 
967 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  37.66 
 
 
670 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  37.66 
 
 
670 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.5 
 
 
612 aa  49.3  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0478  2,4-dienoyl-CoA reductase  41.67 
 
 
689 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523998  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.27 
 
 
681 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0192  2,4-dienoyl-CoA reductase  41.67 
 
 
677 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.804371  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1562  2,4-dienoyl-CoA reductase  41.67 
 
 
677 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1367  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  41.67 
 
 
677 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2719  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  41.67 
 
 
677 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0222  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  41.67 
 
 
677 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2575  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  41.67 
 
 
677 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0995  2,4-dienoyl-CoA reductase  41.67 
 
 
677 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  41.18 
 
 
484 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0094  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  38.2 
 
 
673 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1515  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.2 
 
 
673 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0916177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  39.6 
 
 
484 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1598  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.2 
 
 
673 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  45.16 
 
 
487 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3687  2,4-dienoyl-CoA reductase  34.83 
 
 
679 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.46 
 
 
677 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  28.65 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  30.11 
 
 
390 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3398  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.16 
 
 
680 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2951  2,4-dienoyl-CoA reductase  38.24 
 
 
677 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.140431 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4342  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.17 
 
 
683 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.239319 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02526  2,4-dienoyl-CoA reductase  34.45 
 
 
679 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1273  2,4-dienoyl-CoA reductase  37.08 
 
 
722 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.988489  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.57 
 
 
678 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309437  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.72 
 
 
895 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4232  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.17 
 
 
683 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.14 
 
 
914 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  48.08 
 
 
374 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  44.12 
 
 
469 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5223  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.72 
 
 
686 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493589  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.16 
 
 
501 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1452  2,4-dienoyl-CoA reductase  39.78 
 
 
681 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
686 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3770  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 
387 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  35.44 
 
 
991 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4041  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.89 
 
 
680 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117135  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  57.89 
 
 
474 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2310  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40 
 
 
671 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00279391  hitchhiker  0.0000579308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  58.54 
 
 
469 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.83 
 
 
478 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3639  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.1 
 
 
677 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.664149  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4001  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.89 
 
 
680 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.504416  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  44.07 
 
 
2126 aa  46.2  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.29 
 
 
1073 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>